25 видов для проекта "25 геномов"

В честь 25-летия Института Сенгера в 2018 году, Институт и его партнеры секвенируют 25 новых геномов видов, обитающих в Великобритании. Финальные пять видов были выбраны в результате онлайн-голосования, в котором участвовали тысячи школьников и общественность со всего мира.

Проект может объяснить, почему одни популяции бурых форелей мигрируют в открытый океан, а другие — нет, рассказать больше о магниторецепторах в глазах малиновок, позволяющих им "видеть" магнитные поля Земли, и пролить свет на уязвимость обыкновенных белок к вирусу беличьей оспы, в то время как серые белки являются переносчиками, но не болеют.

Все результаты будут находиться в открытом доступе и лягут в основу будущих исследований для понимания биоразнообразия Великобритании и помогут в сохранении этих видов.

Геном — это полный набор генетических инструкций организма, записанный в ДНК. После завершения проекта "Геном человека" в 2003 году, Институт Сенгера стал мировым лидером в области геномики, создав референсные геномы мыши, рыбок данио, свиньи, гориллы, комара и многих других, включая возбудителей инфекций (сальмонелла, MRSA, хламидия, малярия).

Теперь Институт Сенгера и партнеры проводят полное секвенирование 25 видов из Великобритании. Этот проект — небольшой вклад в более масштабную задачу по секвенированию всей жизни на Земле.

Проект стал возможен благодаря технологии длинного чтения PacBio®, которая позволяет получать высококачественные геномы. Институт сотрудничает с PacBio, 10x Genomics и Illumina для создания наиболее полной картины этих геномов.

Высококачественные геномы позволят ученым понять, как виды в Великобритании реагируют на давление окружающей среды и какие генетические секреты позволяют им процветать или, наоборот, приходить в упадок.

25 видов разделены на 5 категорий:

• Процветающие (Flourishing): Серая белка, Бархатница воловий глаз, Кустовая кобылка Резеля, Крестовник Оксфордский.
• Вымирающие (Floundering): Обыкновенная белка, Водяная полевка, Обыкновенная горлица, Весенняя каменная муха.
• Опасные (Dangerous): Борщевик Мантегацци, Не-тронь-меня железистая, Морской гребешок, Новозеландский плоский червь.
• Знаковые (Iconic): Беркут, Ежевика, Зарянка, Красный каменщик (пчела).
• Скрытные (Cryptic): Бурая форель, Нетопырь-карлик, Печеночник Каррингтона, Летний трюфель.
• Выбраны публикой: Обыкновенная морская звезда, Болотный паук-охотник, Кошачья акула, Азиатский шершень, Речная выдра.

Цитаты:

• Проф. сэр Майк Страттон: "Мы вносим свой вклад в секвенирование всей жизни на Земле".
• Д-р Джулия Уилсон: "Секвенирование этих 25 геномов позволит ученым лучше понять виды Великобритании, их эволюцию и адаптацию к меняющейся среде".
• Кен Скелдон: "Возможность для общественности выбрать виды привнесла в проект новые перспективы".
• Тим Литтлвуд (Музей естественной истории): "Фокус на биоразнообразии Великобритании с использованием передовых технологий особенно важен".