25 новых геномов к 25-летию Института Сэнгера

В честь 25-летия Института Сэнгера Wellcome Trust в 2018 году Институт и его партнеры секвенируют 25 новых геномов. От ежевики до малиновки, от кузнечика до кумжи — все 25 видов обитают в Великобритании и представляют богатство видов этой страны. Двадцать видов уже выбраны, а оставшиеся пять будут определены путем публичного голосования и голосования школьников в рамках проекта 'I'm a Scientist, Get Me Out of Here'.

Результаты будут общедоступны и лягут в основу будущих исследований для понимания биоразнообразия Великобритании, а также помогут в сохранении и изучении этих видов.

Институт Сэнгера был основан в 1993 году профессором сэром Джоном Салстоном в рамках проекта "Геном человека". Институт внес крупнейший отдельный вклад в создание "золотого стандарта" последовательности первого генома человека, опубликованного в 2003 году.

С момента знакового завершения проекта "Геном человека" Институт Сэнгера стал всемирно признанным лидером в области геномики. Было секвенировано множество других важных референсных геномов — от мыши и рыбки данио до свиньи, гориллы, комара и многих других. Помимо видов животных, в списке референсных геномов значительное место занимают возбудители инфекционных заболеваний и бактерии — от сальмонеллы и MRSA до хламидии и малярии.

Теперь Институт Сэнгера и его партнеры проводят полное секвенирование 25 видов из Великобритании. Этот проект — небольшой вклад в гораздо более масштабную задачу, в рамках которой ученые со всего мира объединяются, чтобы составить план по секвенированию всей жизни на Земле.

Высококачественные геномы откроют ученым возможность использовать эту информацию. Исследователи смогут выяснить, как виды в Великобритании реагируют на давление окружающей среды и какие секреты позволяют им процветать или, наоборот, приходить в упадок.

Проект стал возможен благодаря технологии длинного чтения PacBio, которая позволяет получать высококачественные геномы для сборки. Институт сотрудничает с PacBio и другими лидерами технологического сектора, 10x Genomics и Illumina, чтобы создать наиболее полную картину этих геномов.

25 видов разделены на пять категорий в зависимости от их общих характеристик:

• Процветающие — виды, численность которых в Великобритании растет.
• Приходящие в упадок — исчезающие и сокращающиеся виды.
• Опасные — инвазивные и вредоносные виды.
• Знаковые — квинтэссенция британских видов, которые узнают все.
• Скрытные — виды, которые трудно увидеть или которые неотличимы от других по внешнему виду.

На данный момент выбраны 20 из 25 видов. Оставшуюся "большую пятерку" определят путем голосования школьников и общественности в рамках 'I'm a Scientist, Get Me Out of Here' с 6 ноября по 8 декабря 2017 года. Ученые и команды из Института Сэнгера, кампуса Wellcome Genome Campus, Музея естественной истории и других учреждений будут "лоббировать" свой вид и соревноваться за публичные голоса. Пять финалистов завершат список видов для секвенирования.