Генетический код 66 000 видов Великобритании будет секвенирован

Генетические коды 66 000 видов в Великобритании планируется секвенировать Институтом Сэнгера (Wellcome Sanger Institute) и его партнерами в рамках глобальной инициативы по секвенированию геномов всех 1,5 миллионов известных видов животных, растений, простейших и грибов на Земле.

Британский проект, известный как Darwin Tree of Life Project, официально стартует сегодня в Лондоне (1 ноября) вместе с глобальной инициативой Earth BioGenome Project (EBP).

Институт Сэнгера выступит геномным хабом в Великобритании и будет сотрудничать с Музеем естественной истории в Лондоне, Королевскими ботаническими садами Кью, Институтом Эрлхэма, Edinburgh Genomics, Эдинбургским университетом, EMBL-EBI и другими в сборе образцов, секвенировании ДНК, сборке и аннотировании геномов и хранении данных. Проект будет координироваться с другими группами, вносящими вклад в EBP, такими как G10K Vertebrate Genomes Project (VGP) и 10,000 Genomes Plant Project.

Проект Darwin Tree of Life оценивается примерно в 100 миллионов фунтов стерлингов за первые пять лет, а секвенирование геномов 66 000 видов займет около 10 лет.

В честь 25-летия Института Сэнгера институт и его партнеры использовали технологию длинного чтения PacBio и протоколы, разработанные VGP, для первого секвенирования геномов 25 видов Великобритании, включая красную и серую белок, европейского малиновку, доломеда и ежевику. Полученные данные легли в основу для масштабирования до 66 000 видов.

Все данные будут храниться в базах данных общего доступа и бесплатно доступны для исследований.

Цитаты:

• Профессор сэр Майк Страттон, директор Института Сэнгера: "Используя биологические данные, которые мы получим из геномов всех эукариотических видов, мы можем взглянуть на наши обязанности как хранителей жизни на этой планете... в то время, когда природа находится под значительным давлением".
• Профессор Харрис Левин, Калифорнийский университет в Дэвисе, председатель EBP: "Проект Darwin Tree of Life является чрезвычайно важным достижением для Earth BioGenome Project и послужит моделью для других национальных усилий".
• Сэр Джим Смит, директор по науке Wellcome: "От природы мы получим представление о том, как разрабатывать новые методы лечения инфекционных заболеваний, определять лекарства для замедления старения, создавать новые подходы к обеспечению мира продовольствием или создавать новые биоматериалы".