Виртуальная база данных 3D-моделей скелетов уникальной австралийской фауны
Впервые особенности уникальной дикой природы Австралии — от утконоса, билби, кенгуру, коалы и эму до вымерших млекопитающих — стали доступны для всех в виде их костей и скелетов в новой бесплатной онлайн-коллекции.
Используя технологию 3D-сканирования, Университет Флиндерса и партнеры запустили виртуальную базу данных "Ozboneviz". Она позволяет "заглянуть внутрь" анатомии десятков самых известных животных Австралии для публики, школ, исследователей, художников и любителей природы.
Как описано в новой статье в журнале BioScience, коллекция из более чем 1600 образцов была собрана и загружена в высокотехнологичное хранилище MorphoSource лабораторией "Bones and Biodiversity Lab" доцента Университета Флиндерса Веры Вайсбекер и коллегами со всей Австралии.
"Нас всех завораживают кости, и эта новая база данных — способ заглянуть за стеклянные витрины музея, рассмотреть образцы вблизи и понять их особенности", — говорит доцент Вайсбекер.
Она надеется, что Ozboneviz поможет лучше оценить удивительных австралийских млекопитающих как в научной среде, так и среди широкой публики по всему миру.
"Австралия лидирует в мире по вымиранию млекопитающих, но мы теряем гораздо больше, чем несколько пушистых крысоподобных созданий. Наши млекопитающие эволюционировали в изоляции почти 40 миллионов лет — им просто нет аналогов где-либо еще".
Как создавалась коллекция
Основная команда провела три года, посещая четыре австралийских музея и три университета. Для оцифровки использовались в основном поверхностные сканеры. Были отсканированы десять ключевых костей 189 знаковых видов Австралазии: череп, лопатка, таз и кости конечностей.
"Для большинства костей мы использовали сканер структурированного света, чтобы получить изображение их поверхности. Но для особенно редких видов, таких как предположительно вымерший нгудлуканта (пустынный кенгуровый хомячок), мы выбрали компьютерную томографию, потому что она также показывает внутреннюю структуру костей с разрешением 10–50 микрометров", — объясняет Джейкоб ван Зулен, аспирант Университета Флиндерса и менеджер по оцифровке.
Полученные 3D-файлы размещены на платформе MorphoSource, что важно для ученых, так как она имеет такую же строгую каталогизацию, как и любой физический музей. Файлы находятся в открытом доступе, и любой может скачать их для некоммерческого использования.
Доступ для широкой публики
Для облегчения публичного доступа также был создан сайт на Sketchfab с более чем 500 самыми ценными и информативными костями. Примеры включают:
- Череп вымершего сумчатого волка (тилацина).
- Свиноногий бандикут.
- Пустынный кенгуровый хомячок.
- Редкая сумчатая крота.
"Это означает, что публика может, например, сравнить череп лисы, тилацина и динго, а также сравнить размер и форму костей конечностей обычных сумчатых", — добавляет доктор Эрин Майн. — "Также есть множество аннотаций, которые помогут неспециалистам изучить анатомию позвоночных и сравнить анатомические признаки между видами".
Помимо крупных местных млекопитающих (кенгуру, поссумы, бандикуты), база данных включает некоторых интродуцированных животных (козы, овцы), а также выборку крупных птиц, ящериц и лягушек.
Уникальные экспонаты
Коллекция MorphoSource включает ряд образцов с интересными особенностями или историями:
- Скелет Билли, дельфина из реки Порт, хорошо известного жителям Аделаиды.
- Длинноклювая ехидна Аттенборо (Zaglossus attenboroughi) — ранее считалась вымершей, но была повторно обнаружена в дикой природе примерно во время сканирования образца.
- Вымерший свиноногий бандикут (Chaeropus ecaudatus) — единственное сумчатое животное с подобием копыт.
- КТ-сканы двух целых сумчатых кротов (род Notoryctes), которые, по словам доцента Вайсбекер, являются "самым странным скелетом Австралии".
Доцент Вайсбекер отмечает, что в Австралии нет прецедентов создания подобных баз данных с открытым доступом.
"Надеюсь, это проложит путь к еще более широкому использованию оцифровки, чтобы сделать уникальное местное биоразнообразие Австралии доступным для мировой общественности".