Исследование проливает свет на эволюцию малоизученных змей Homalopsidae из Юго-Восточной Азии
Новое геномное исследование Университета Канзаса (University of Kansas, KU) переписывает эволюционную историю семейства неярких, но уникальных «болотных» или «грязевых» змей Homalopsidae из Юго-Восточной Азии. Результаты опубликованы в Bulletin of the Society of Systematic Biologists.
Эти змеи обитают в пресных, солоноватых или солёных водах у побережья и внутри материка, ведут ночной образ жизни, питаясь рыбой и ракообразными.
Методология: объединение «музейной» и современной геномики
Исследование под руководством Джастина Бернстайна (Justin Bernstein) из KU Center for Genomics построило наиболее полное на сегодняшний день эволюционное древо Homalopsidae. Для этого учёные совместили два подхода:
- Анализ митохондриальной ДНК старых музейных образцов (метод «музейной геномики» или museumomics).
- Высокоточный анализ ядерной ДНК (данные с 4800 локусов в каждом геноме) из свежих образцов, собранных в полевых условиях.
Это позволило заполнить пробелы в знаниях и точно реконструировать биогеографическую историю семейства.
Опровергнутая гипотеза и новое понимание
Исследование опровергло долгое время существовавшую гипотезу. Учёты, включая Бернстайна, предполагали, что колебания уровня моря в эпоху плейстоцена (ледниковые периоды) действовали как «видообразовательный насос» для этих змей. Однако данные показали, что «изменения уровня моря в плейстоцене и специфика местообитаний не были основной причиной современного видового разнообразия Homalopsidae».
Вместо этого, вероятным драйвером видообразования стали события примерно на 15–20 миллионов лет раньше, в олигоцене. Тогда движение тектонических плит и изменение русел рек в Юго-Восточной Азии могли неоднократно разрывать и восстанавливать поток генов между группами змей, что и привело к их диверсификации.
Наследие пионерской работы
Исследование продолжает работу Ко Ко Ги (Ko Ko Gyi), эволюционного биолога из Мьянмы, который в 1970 году провёл «монументальное» исследование Homalopsidae в KU Natural History Museum, не имея доступа к анализу ДНК. Его идеи, основанные на морфологии (включая детальные рентгеновские снимки черепов), теперь подтверждены молекулярными данными.