Исследователи идентифицировали микробиом кишечника улиток столетней давности

В июле 1920 года ученый из Колорадо Джуниус Хендерсон собрал группу улиток Oreohelix strigosa (Скалистогорская улитка) в районе Дакоты Хогбэк. Он сохранил образцы в этаноле в коллекции Музея естественной истории Университета Колорадо.

Спустя столетие экологи из того же музея впервые применили современные инструменты секвенирования ДНК для идентификации микробов, живших в кишечнике животных, мертвых уже 100 лет. Исследование показало, что музейные коллекции — неожиданное окно в прошлые взаимодействия животных со средой.

Ключевые результаты:

• В кишечнике каждой улитки обнаружены следы более 7000 микроорганизмов, в основном бактерий.
• ДНК в образцах, хранившихся в этаноле с 1920 года, не деградировала — их микробиом был столь же разнообразен, как у свежесобранных улиток.
• Состав микробиома за век немного изменился. Например, в улитках 1920 года преобладали бактерии родов Bradyrhizobium, Alicycliphilus и Cloacibacterium, а в образцах 2018 года — Flavobacterium и семейства Chitinophagaceae и Cerasicoccaceae.
• Место обитания (около 20% вариаций) влияло на микробиом сильнее, чем время сбора.
• Многие обнаруженные бактерии способны расщеплять сложные органические молекулы (например, целлюлозу в листьях), помогая улиткам выживать.

Значение исследования:

Это открывает возможность изучать исторические микробиомы миллионов музейных образцов животных (пауков, лягушек, змей), хранящихся в этаноле, для ответов на современные экологические вопросы.

Тревожный сигнал:

Некоторые популяции улиток, собранные в прошлом в округе Боулдер, сегодня, возможно, исчезли из-за засух и лесных пожаров, угрожающих этим влаголюбивым животным.