Микробиом неандертальцев и бактерии, важные для нашего здоровья

Микробиота кишечника неандертальцев включала полезные микроорганизмы, которые также встречаются в микробиоме современного человека. Международная группа исследователей под руководством Болонского университета получила этот результат, извлекая и анализируя древнюю ДНК из 50 000-летних фекальных отложений, взятых на археологическом участке Эль-Сальт в Испании.

В статье, опубликованной в Communication Biology, выдвигается гипотеза о существовании древних компонентов микробиоты человека, которые населяли желудочно-кишечный тракт ещё до разделения Homo sapiens и неандертальцев, произошедшего более 700 000 лет назад.

Проблемы «современной» микробиоты

Современные особенности жизни — потребление обработанной пищи, использование лекарств, жизнь в гиперсанитарных условиях — привели к критическому сокращению биоразнообразия микробиоты кишечника. Это истощение связано в основном с потерей группы микроорганизмов, называемых «старыми друзьями». В западных странах отмечается резкий рост случаев хронических воспалительных заболеваний, таких как воспалительные заболевания кишечника, метаболический синдром, диабет 2-го типа и колоректальный рак.

Как может помочь «древняя» микробиота

Учёные ищут целенаправленные решения, пытаясь определить ключевые, эволюционно консервативные компоненты микробиоты человека. Развитие технологий позволило исследовать древние микроорганизмы по археологическим останкам с помощью секвенирования ДНК — это новая область палеомикробиологии.

Исследователи проанализировали древнюю ДНК, извлечённую из 50 000-летних фекальных осадков с участка Эль-Сальт. Это самый старый образец фекального материала на сегодняшний день. Удалось восстановить состав микроорганизмов, населявших кишечник неандертальцев. Сравнение с микробиотой современных людей выявило множество сходств.

Был выделен набор микроорганизмов, общих с современным Homo sapiens. Это указывает, что эти древние микроорганизмы населяли кишечник нашего вида ещё до разделения с неандертальцами (~700 000 лет назад).

Сохранение микробиоты

Эти древние компоненты включают многие важные для здоровья бактерии:

• Blautia, Dorea, Roseburia, Ruminococcus, Faecalibacterium — производят короткоцепочечные жирные кислоты из пищевых волокон, регулируя метаболический и иммунный баланс.
• Bifidobacterium — играет ключевую роль в регуляции иммунной защиты, особенно в раннем детстве.

Среди микробиоты неандертальцев также были идентифицированы некоторые «старые друзья», что подтверждает их древнюю природу и недавнее истощение из-за современного образа жизни.

В условиях прогрессирующего сокращения разнообразия микробиоты эта информация может помочь в разработке комплексных стратегий, учитывающих диету и образ жизни, для сохранения микроорганизмов, фундаментально важных для нашего здоровья.