Расшифрован геном северного оленя

Опубликована работа, описывающая секвенирование и анализ генома северного оленя (Rangifer tarandus). Исследование опубликовано в открытом журнале GigaScience.

Уникальные особенности вида:

• Это единственный полностью одомашненный вид в семействе оленевых (Cervid).
• Единственный олень с всемирным ареалом: бореальные, тундровые, субарктические, арктические и горные регионы Северной Азии, Северной Америки и Европы.
• Рога растут и сбрасываются как у самцов, так и у самок.
• Молоко северного оленя значительно богаче белком и содержит меньше лактозы, чем коровье молоко.

Ход исследования:

Работу выполнила команда китайских исследователей. Образец крови был взят у двухлетней самки домашнего северного оленя из стада, которое содержат кочевые охотники-оленеводы эвенки в горах Большого Хингана (Китай). Учёные отсеквенировали, собрали и аннотировали геном, показав его высокое качество.

Ключевые результаты:

• Размер генома северного оленя составляет 2,6 Гб (2,6 млрд пар оснований). Это немного меньше, чем у человека, коровы и козы, и примерно равно размеру генома овцы.
• Выявлено 335 специфичных для северного оленя генов, которые могут помочь понять его особые биологические характеристики и эволюцию всего семейства оленевых.
• Построено эволюционное древо. Установлено, что северный олень, крупный рогатый скот и козы отделились от общего предка примерно 29,6 млн лет назад, в эпоху олигоцена.

Статья стала одним из победителей конкурса GigaScience, направленного на продвижение новых передовых исследований. Работа была представлена на 12-й ежегодной Международной конференции по геномике в Шэньчжэне. Публикация проходила в рамках открытой науки: черновая версия статьи была доступна на препринт-сервере Biorxiv, рецензирование проводилось открыто в системе Academic Karma, а вся переписка между редакторами, авторами и рецензентами опубликована вместе со статьёй.