Опубликованы семь черновых геномов северных видов зайцев

Исследователи из Университета Восточной Финляндии совместно с коллегами из Шведского университета сельскохозяйственных наук опубликовали семь черновых геномов для видов северных зайцев.

В число геномов вошли три генома зайца-русака (Lepus timidus sylvaticus) — подвида зайца-беляка, уникального для южной Скандинавии и западной Эстонии. В отличие от типичной для бореальных/арктических горных зайцев (Lepus timidus timidus) белой зимней шерсти, у русака зимний мех серо-голубого цвета. Считается, что такая окраска является специфической адаптацией к менее устойчивому снежному покрову в южной Скандинавии.

Ареал русака пересекается с ареалом интродуцированного зайца-русака обыкновенного, который, судя по всему, вытесняет русака повсюду, где они сосуществуют. Вместе с угрозой от изменения землепользования эта конкуренция поставила уникально адаптированный подвид зайца-беляка под угрозу исчезновения.

Геномные данные помогают понять генетическую основу признаков, важных для специфических адаптаций, и дают информацию об эволюционных связях и историческом происхождении популяций. Поэтому были получены первые полные геномные последовательности от трёх русаков, двух горных зайцев и двух зайцев-русаков обыкновенных.

Довольно неожиданно геном русака заметно отличался от геномов номинальных горных зайцев, несмотря на тысячи лет сосуществования. Это показывает, что различие подвидов не ограничивается локальной адаптацией, а представляет собой уникальное, древнее эволюционное расхождение. Это позволяет предположить, что русак колонизировал Скандинавию с юга после последнего ледникового периода, тогда как современный горный заяц, вероятно, прибыл позже с северо-востока.

Полученные геномные последовательности также полезны для скрининга генетических вариаций, которые можно использовать для изучения генетической дифференциации и локальных адаптаций. Надеемся, что эти данные предоставят органам власти инструменты для оценки статуса уникального русака и помогут усилиям по его сохранению.

Результаты опубликованы в журнале Scientific Data.