Геномные данные о прошлом и будущем чёрного носорога
Знаковый африканский чёрный носорог (Diceros bicornis) сталкивается с неопределённым будущим после того, как интенсивное браконьерство вызвало 98%-ное сокращение диких популяций с 1960 по 1995 год. Хотя численность в настоящее время растёт, животное остаётся в критической опасности.
Новое исследование, опубликованное в Molecular Biology and Evolution, «Historic Sampling of a Vanishing Beast: Population Structure and Diversity in the Black Rhinoceros», меняет наше понимание эволюционной и естественной истории чёрного носорога.
Исследование генетического прошлого
- Цель: Изучить популяционную структуру и геномное разнообразие вида до и после его катастрофического сокращения в прошлом веке.
- Материал: Учёные секвенировали геномы 63 музейных образцов, собранных с 1775 по 1981 год, и 20 особей из современных популяций, создав наиболее полный генетический набор данных по виду.
- Метод: Использование полногеномного секвенирования, которое, по словам ведущего автора Йошана Мудли, «выявило гораздо более релевантную для сохранения популяционную структуру, чем ожидалось от традиционных маркеров».
Ключевые открытия
- Историческая структура: Анализ выявил существование шести основных исторических популяций чёрного носорога и четырёх субпопуляций, что позволило точнее определить их границы.
- Эволюционные драйверы: Тектонические разломы в Африке в эпоху плейстоцена «привели к эволюции нескольких до сих пор неизвестных популяций, многие из которых, вероятно, всё ещё существуют в современной кенийской метапопуляции».
- Генетическая изоляция: Эволюционная история вида формировалась как географическими барьерами, так и вторичными контактами между популяциями. Это привело к выраженной модели «изоляции расстоянием» по всей территории Африки к югу от Сахары.
- Инбридинг: Современные образцы демонстрируют глубокое влияние сокращения популяций и последующего генетического дрейфа. Особенно сильно пострадали южноафриканские особи, у которых зафиксирован самый высокий уровень инбридинга. Некоторые популяции демонстрировали признаки инбридинга, предшествовавшие колониальному периоду.
Призыв к действию для сохранения вида
Исследование содержит настоятельный призыв улучшить охрану и управление популяциями чёрного носорога:
- Приоритет для Восточной Африки: «Абсолютно необходимо, чтобы новые популяции, выявленные в Восточной Африке, получили наивысший приоритет сохранения». Авторы настаивают на всестороннем генетическом тестировании носорогов в Кении и Танзании.
- Отдельное управление: Уникальные эволюционные группы, такие как субпопуляции Рувумы, Масаи-Мара–Серенгети и, возможно, национального парка Чулу, должны управляться отдельно для сохранения их уникальных генетических линий.
Исследование отдаёт дань уважения покойному профессору Майку Бруфорду из Кардиффского университета, соавтору проекта и видному деятелю в области генетики сохранения видов.