Новые геномные данные панголинов помогут в их сохранении

Исследование, опубликованное в журнале Molecular Biology and Evolution, впервые предоставляет комплексный набор геномных ресурсов для панголинов (также известных как ящеры), который, по мнению учёных, будет важен для защиты этих находящихся под угрозой млекопитающих.

Работа озаглавлена "Геномы панголинов предлагают ключевые идеи и ресурсы для самых нелегально торгуемых диких млекопитающих в мире".

Панголины, обитающие в Азии и Африке к югу от Сахары, — единственные млекопитающие, покрытые чешуёй. Они подвергаются рекордному по масштабам нелегальному отлову из-за мяса и предполагаемых лечебных свойств. Животные также находятся в опасности из-за широкомасштабной вырубки лесов в местах их обитания. Восемь сохранившихся видов панголинов стали объектом повышенного внимания общественности и природоохранных усилий в последние годы, в основном из-за того, что они являются самыми нелегально торгуемыми дикими млекопитающими на Земле, а также из-за недавнего (ошибочного) предположения об их возможной связи с пандемией COVID-19.

Несмотря на критическую ситуацию с сохранением, панголины остаются малоизученными, сохраняются значительные пробелы в базовых исследованиях видов или популяций. Исследователи всё чаще обращаются к геномике в изучении дикой природы, поскольку она предоставляет данные для более точной информации о видовых или популяционных границах, демографии, разнообразии, исторических траекториях и адаптивной способности животных к глобальным изменениям. Она также может помочь отследить происхождение нелегально торгуемых особей, чтобы эффективнее определять очаги браконьерства и разрушать сети торговли.

Получение полногеномной информации о панголинах — сложная задача. Во-первых, географическая изоляция видов панголинов друг от друга и ограниченные палеонтологические данные создают методологические препятствия. Азиатские и африканские виды панголинов разделились около 37,9 миллионов лет назад, что затрудняет понимание эволюции группы при использовании референсного генома далёкого вида. Во-вторых, скрытное поведение животных и их тропическое распространение делают генетический отбор проб дорогим и трудоёмким.

В данном исследовании учёные секвенировали, собрали и аннотировали первый референсный геном гигантского панголина, обитающего в Африке, а также секвенировали и собрали геномы чёрнобрюхого, степного, индийского и филиппинского панголинов. Эти новые геномные данные вместе с ранее опубликованной информацией по оставшимся трём видам — белобрюхому, яванскому и китайскому панголинам — предоставляют первый полный набор геномов для панголинов. В процессе работы исследователи также идентифицировали потенциально новый вид панголина на основе ранее опубликованных геномных данных.

Исследователи полагают, что эта информация, которая в конечном итоге даст полное представление о том, как панголины эволюционировали во времени в ответ на меняющиеся условия окружающей среды, предоставит важные детали для эффективной защиты животных через определение природоохранных приоритетов и планов управления в ближайшие годы. Результаты также будут полезны для разработки ДНК-инструментов для отслеживания торговли панголинами.

"Совместный характер этого исследования с участием авторов из Африки, Азии и Европы позволил нам впервые глубоко взглянуть на эволюцию панголинов всех восьми видов через призму полного генома", — сказал Шон Хейтон, один из авторов статьи. — "Мы надеемся, что эти геномы станут основой для дальнейших генетических исследований, которые помогут в сохранении животных".