Новые геномы для спасения самого незаконно торгуемого животного в мире

Панголины — уникальные млекопитающие, покрытые чешуей. Несмотря на чешую, их часто считают очаровательными. Они играют ключевую роль в своих экосистемах.

Однако панголины также являются самыми незаконно торгуемыми дикими животными в мире: за последние два десятилетия было браконьерено более 900 000 особей. Это связано с высоким спросом на их мясо и чешую для использования в традиционной медицине.

Многие виды панголинов оказались на грани исчезновения. В частности, малайский (Manis javanica) и китайский (Manis pentadactyla) панголины находятся под острым давлением и с 2014 года имеют статус находящихся на грани исчезновения в Красном списке Международного союза охраны природы (IUCN).

Новое исследование, приуроченное ко Всемирному дню панголина (15 февраля, представляет высококачественные геномные данные для этих видов, проливая свет на их генетическую уязвимость и риск вымирания.

Работа выполнена китайскими учеными из Исследовательского центра по сохранению панголинов Государственного управления лесного и степного хозяйства, Северо-Восточного лесного университета и BGI-Шэньчжэнь. Исследование опубликовано в журнале GigaScience.

Генетический анализ на основе высококачественных данных

Ученые создали геномные последовательности китайского и малайского панголинов с значительно более высоким разрешением, чем ранее доступные. Почти бесщелевая последовательность хромосомного уровня позволила провести детальную оценку генетического здоровья популяций.

Анализ включал:

• Оценку генетического разнообразия — показатель генетической вариативности между особями в популяции. Чем выше разнообразие, тем здоровее будущие поколения.
• Оценку уровня инбридинга — показатель вероятности наследования серьезных проблем со здоровьем.

Такие данные помогают определить оптимальные стратегии спасения, например, необходимость селекционного разведения.

Результаты: скрытые риски для популяций

Используя новые высококачественные данные в качестве референса, а также ранее опубликованные геномные данные 37 особей китайского и 72 особей малайского панголина, ученые переоценили генетический статус пяти популяций.

• Общее генетическое разнообразие оказалось неожиданно высоким, что является положительным знаком.
• Однако детальный анализ показал, что некоторые популяции подвергаются более высокому риску вымирания, чем другие.
  • Одна из популяций пережила гораздо более быстрое и резкое сокращение численности за последние 10 000 лет.
  • Другие генетические параметры указали на очень высокий риск исчезновения именно для этой популяции.
• Анализ образца панголина с Тайваня также выявил тревожные данные.

Практическое значение для сохранения вида

Полученные данные подчеркивают необходимость дальнейшего изучения различий между локальными популяциями для оптимизации программ генетического спасения.

Профессор Тяньмин Лань отмечает: «Помимо борьбы с браконьерством и незаконной торговлей, правительство Китая создало центр разведения для сохранения китайского и малайского панголинов и разработало программу искусственного разведения и воспроизводства. С помощью этих данных мы сможем лучше оценивать стратегии генетического спасения диких популяций путем реинтродукции и выпуска выращенных в неволе особей в будущем».