Исследователи определили болезнь, от которой мог страдать 700-летний скелет
Европейские исследователи восстановили геном бактерии Brucella melitensis из 700-летнего скелета, найденного в руинах средневековой итальянской деревни.
Учёные использовали метод shotgun метагеномики для секвенирования ДНК из кальцифицированного узелка в тазовой области скелета мужчины средних лет. Скелет был раскопан в поселении Гериду на Сардинии, заброшенном в конце XIV века. Этот метод позволяет секвенировать ДНК без поиска конкретной мишени.
Из образца был восстановлен геном Brucella melitensis — возбудителя бруцеллёза у животных и людей. У людей заражение обычно происходит при употреблении непастеризованных молочных продуктов или прямом контакте с инфицированными животными. Симптомы включают лихорадку, артрит и отёк сердца и печени. Болезнь до сих пор встречается в Средиземноморском регионе.
"Обычно, думая о кальцифицированном материале в останках, вы думаете о туберкулёзе, потому что это наиболее частая инфекция, приводящая к кальцификации. Мы были немного удивлены, обнаружив вместо этого Brucella", — говорит старший автор исследования Марк Паллен.
В области таза скелета было обнаружено 32 затвердевших узелка размером с монету, хотя их точное происхождение неясно.
Дополнительные эксперименты показали, что извлечённые фрагменты ДНК имели признаки древней ДНК: они были короче современных и имели характерные мутации на концах. Средневековый штамм, названный Geridu-1, оказался тесно связан с современным штаммом Ether, выявленным в Италии в 1961 году, и двумя другими итальянскими штаммами 2006 и 2007 годов.
Метод shotgun метагеномики ранее уже использовался для обнаружения патогенов в современных и исторических образцах. Команда Паллена сейчас тестирует его на ряде дополнительных материалов, включая:
- Исторические образцы из венгерских и египетских мумий.
- Корейскую мумию XVI–XVII веков.
- Лёгочную ткань французской королевы из династии Меровингов (V–VIII вв.).
- Современные образцы мокроты из Гамбии в Африке.
"Метагеномика готова документировать прошлые и настоящие инфекции, проливая свет на возникновение, эволюцию и распространение микробных патогенов. Мы просматриваем все эти образцы и надеемся найти что-то новое", — отмечает Паллен.
Исследование опубликовано в онлайн-журнале с открытым доступом mBio.