Реконструкция генома выявила ранее неизвестного паразита в рыбах по всему миру

Учёные с помощью реконструкции генома выявили ранее «невидимого» паразита рыб, относящегося к апикомплексным — одной из важнейших групп паразитов в клиническом отношении. Этот паразит распространён по всему миру, но оставался незамеченным в предыдущих исследованиях.

Международная исследовательская группа под руководством учёных из Университета Майами и Института эволюционной биологии (IBE) охарактеризовала нового паразита в рыбе красногубый бленни, обитающей в тропических рифах. Исследование, опубликованное в Current Biology, использовало инновационный метод для реконструкции части генома паразита из данных секвенирования его хозяина.

Раскрыт «невидимый» паразит

Геномные данные показали, что паразит принадлежит к ранее не охарактеризованной группе организмов, названных ихтиоколидами (от латинского «обитающий в рыбе»).

«Хотя его ранее идентифицировали с помощью микроскопии, мы не могли отделить геномный сигнал рыбы-хозяина от паразита. Впервые мы смогли идентифицировать их по ДНК и отнести к известной группе апикомплексных паразитов», — заявил ведущий исследователь Хавьер дель Кампо.

Паразит присутствует в рыбах по всему миру

Реконструкция генома позволила выявить гены, которые можно использовать для обнаружения этого организма в других образцах, как «штрих-код». Сравнение ДНК с публичными базами данных микробиомов сотен видов пресноводных и морских рыб показало, что эти паразиты присутствуют у большинства проанализированных морских видов и во всех океанах.

Таким образом, это один из самых распространённых паразитов морских рыб, что может иметь последствия для коммерческого рыболовства и океанических пищевых сетей.

Новый член группы апикомплексных паразитов

Ихтиоколиды принадлежат к Apicomplexa — большой группе паразитов, включающей возбудителей малярии и токсоплазмоза. Они не представляют прямого риска для здоровья человека, но важны для изучения здоровья морских экосистем и эволюции паразитов человека.

Впервые ихтиоколиды помещены как сестринская группа к недавно описанным обитателям кораллов — коралликолидам.

«Изучение ихтиоколидов не только раскрывает больше об эволюции основных паразитов, но и другие базовые черты апикомплексан, которые могут иметь клиническое значение. Они могут использовать схожие механизмы заражения (поскольку также являются паразитами крови)», — отметил первый автор исследования Энтони Бонаколта.