Учёные полностью расшифровали геном всех штаммов вируса лейкоза гиббонов

Учёные из Берлина секвенировали полный геном всех пяти известных штаммов вируса лейкоза гиббонов (GALV). Исследователи доказали, что естественный отбор сформировал части генома этой группы вирусов. Вероятно, это следствие давления со стороны иммунной системы хозяев, с которым сталкиваются вирусы. GALV являются возбудителями гемопоэтических новообразований, таких как лейкемия, и до сих пор выделялись исключительно от приматов в неволе. Однако GALV используется в биомедицинских исследованиях в качестве вектора для терапии рака. Поэтому секвенирование полных геномов и понимание их эволюции должно помочь повысить их полезность в качестве вирусных векторов. Результаты опубликованы в научном журнале Journal of Virology.

Вирусы лейкоза гиббонов (GALV) — одни из наиболее важных ретровирусных векторов, используемых для переноса генов и генной терапии рака. Несмотря на их биомедицинское значение, полный геном всех пяти известных штаммов до сих пор не был определён, а их эволюционная история — не изучена.

Учёные из Берлинского института зоологии и дикой природы им. Лейбница (IZW) секвенировали полные геномы всех пяти штаммов GALV, используя целевое обогащение и секвенирование нового поколения. На сегодняшний день GALV были выделены только от приматов в неволе, в основном гиббонов, хотя есть серьёзные подозрения, что естественным хозяином являются грызуны или летучие мыши. Филогенетический анализ на основе вновь полученных геномных последовательностей показал, что четыре штамма GALV, выделенные от гиббонов, тесно связаны с вирусом саркомы шерстистой обезьяны, который является штаммом GALV, вероятно, возникшим в организме гиббона. Вместе GALV образуют сестринскую группу хорошо известных коала-ретровирусов (KoRV). С помощью эволюционного подхода было обнаружено, что GALV и KoRV демонстрируют давление отбора на белки, непосредственно участвующие во взаимодействии с хозяином. Это говорит о том, что иммунная система хозяина заставляет вирусы адаптироваться. Особенно важно, что такое давление отбора было выявлено у наиболее патогенных вирусов — тех штаммов GALV, которые являются более онкогенными, и тех штаммов KoRV, которые являются потенциально экзогенными.

GALV входит в большую группу ассоциированных с заболеваниями гаммаретровирусов, обнаруженных у самых разных австралийских млекопитающих. Вирусы, родственные GALV, регулярно обнаруживаются у диких животных, особенно грызунов и летучих мышей. Понимание их разнообразия и эволюции имеет решающее значение для понимания происхождения и распространения основной группы патогенных вирусов.