Молекулярная селекция может улучшить горькие оливки

Оливки, известные своим характерным горьким вкусом, пользуются высоким спросом из-за популярности производимого из них масла. Польза оливкового масла для здоровья хорошо известна — от противовирусного и противоракового до даже антигипертензивного действия. Эти преимущества связаны с олеуропеином, наиболее распространённым в оливках секоиридоидом.

Эффективный метод повышения качества растительной продукции — использование молекулярных методов для манипулирования генами и увеличения урожайности. Однако для оливок это всё ещё сложная задача из-за недостатка данных о геноме.

До сих пор были секвенированы геномы двух европейских сортов оливок. Но для полной расшифровки состава генетического материала необходимо вычислительная сборка этих геномов. С оливками это было трудно сделать из-за большого количества повторяющихся последовательностей в их геномах и их сложной природы.

Команда учёных из Китая под руководством доктора Годонг Рао попыталась решить эту проблему, используя новейшие технологии секвенирования для сборки этих геномов. Доктор Рао объясняет, что в их исследовании «был получен высококачественный геном оливы на уровне хромосом, что значительно улучшило предыдущую версию геномов». Исследование опубликовано в Horticulture Research.

Учёные сначала собрали образцы листьев европейской оливы и выделили их ДНК. Затем они использовали передовые технологии секвенирования Oxford Nanopore третьего поколения и Hi-C для получения последовательностей и применили семь различных стратегий для сборки окончательного генома. Полученный окончательный геном подвергли филогенетическому анализу и сравнению с другими родственными видами растений.

Результаты работы позволили успешно идентифицировать девять семейств генов с 202 генами, участвующими в биосинтезе олеуропеина, что вдвое больше, чем было известно ранее. Учёные также выявили, что часть ДНК оливы похожа на ДНК сои и подсолнечника. Они обнаружили, что оливки генетически наиболее близки к растению олеастер, также называемому русской оливой.

Доктор Рао поясняет: «Благодаря определённой нами высококачественной геномной карте в будущем станет возможным выведение сортов оливок и оливкового масла более высокого качества».