Исследование лемуров: проверка кишечника

Исследователи микробиома кишечника Эрин Маккенни и Лидия Грин собрали сотни образцов стула от дюжины видов приматов, включая лемуров, для изучения триллионов бактерий, которые помогают переваривать пищу и предотвращают инфекции.

В ходе исследования в Центре лемуров Университета Дьюка (2013–2016 гг.) десять лемуров заразились паразитом Cryptosporidium ("крипто"), вызывающим диарею. Все инфицированные животные были сифаками Кофереля — единственным видом лемуров из примерно 20 в Центре, восприимчивым к этому паразиту. Большинству было меньше пяти лет.

Зараженных животных изолировали. Шесть из них лечили антибиотиками, а трое также получили трансплантат фекалий от здорового родственника. Все животные выздоровели.

Используя метод секвенирования 16S рибосомной РНК, ученые проанализировали образцы стула до, во время и после инфекции и сравнили их с образцами 35 здоровых особей.

Результаты:

• И инфекция, и лечение антибиотиками уничтожили значительную часть кишечной флоры, особенно бактериальных групп Bifidobacterium, Akkermansia, Succinivibrio и Lachnospiraceae.
• После выздоровления большинству животных потребовалось несколько недель для восстановления нормального уровня биоразнообразия микробиома. Молодые особи восстанавливались дольше.
• Полное восстановление в рамках периода исследования наблюдалось только у животных, получивших трансплантат фекалий. Это говорит о том, что такое лечение помогает восстановить разнообразие бактерий и ускорить выздоровление.

Ученые отмечают, что процесс повторного заселения кишечника после инфекции "крипто" был похож на процесс, наблюдаемый у детенышей от рождения до отлучения от груди.

Исследование может помочь в контроле вспышек криптоспоридиоза у приматов в неволе. Поскольку лемуры эволюционно ближе к человеку, чем лабораторные мыши, эта работа также способствует пониманию того, как микробиом кишечника защищает людей от подобных инфекций и помогает восстановлению.