Микробы кишечника и эволюция млекопитающих: новый шаг к пониманию

Международная группа учёных под руководством специалистов из Университета штата Орегон разработала новый метод классификации триллионов микробов кишечника, чтобы выяснить, какие из них могут играть важную роль в эволюции человека и других млекопитающих.

Новый алгоритм классификации

Исследователи создали алгоритм и программное обеспечение ClaaTU (cladal taxonomic units), которые группируют микробы на основе их происхождения (общего предка) и распространения среди разных видов млекопитающих. Метод позволяет выявлять микробные клады, которые встречаются в сообществах млекопитающих чаще, чем можно было бы ожидать случайно. Результаты опубликованы в журнале mBio.

Гипотеза и цель исследования

Учёные предполагают, что микробиом кишечника, влияющий на здоровье, может также влиять на способность млекопитающих выживать и размножаться в природе. Это означало бы, что микробы могут играть роль в эволюции. Новый метод ClaaTU — это первый шаг к проверке этой идеи, так как он позволяет сравнивать микробиомы разных видов и выявлять «консервативные» микробные клады, потенциально важные для хозяев.

Ключевое наблюдение

Анализ показал, что у людей, ведущих «западный» образ жизни (диета с высоким содержанием жиров и низким — клетчатки), разнообразие консервативных микробных кладов в кишечнике значительно ниже по сравнению с людьми из не-западных обществ и нечеловекообразными приматами. Это говорит о связи между западным образом жизни, изменениями в окружающей среде и/или генетике и сокращением разнообразия ключевых бактериальных кладов.

Выводы и перспективы

Полученные данные вызывают опасения, что индустриализация могла повлиять на состав микробиома, который эволюционно сформировался у наших предков. Однако для подтверждения того, что выявленные микробы действительно влияют на физиологию млекопитающих и их эволюцию, потребуются дальнейшие исследования.