Исследование лемуров подчеркивает роль диеты в формировании кишечного микробиома
Исследование бактерий в кишечнике трех видов лемуров дает новые представления о роли диеты в формировании этих микробных экосистем и о том, как эти микробы могут быть связаны со здоровьем приматов.
Исследователи изучили три вида лемуров: венценосных лемуров (Varecia variegata) и кошачьих лемуров (Lemur catta), которые в условиях Duke Lemur Center получали идентичную диету из фруктов и овощей, и сифак (Propithecus coquereli), питающихся листьями.
Ученые собрали данные о питательном составе диеты каждого вида в неволе. Затем с помощью методов генетического секвенирования они определили бактериальный состав кишечного микробиома на основе образцов фекалий. Также использовалась спектроскопия ядерного магнитного резонанса (NMR) на образцах фекалий для определения химических продуктов, производимых в кишечнике. Анализ присутствующих бактерий и производимых химикатов позволил понять, как кишечные микробы используют диету каждого лемура.
Ключевой результат: у венценосных и кошачьих лемуров, несмотря на разное строение кишечника (простой, почти прямой у первых и сложный, с изгибами, у вторых), при идентичной диете оказались почти идентичные кишечные микробиомы.
"Это исследование говорит нам, что приматы с очень разными кишечными системами могут иметь очень похожие кишечные микробиомы, если они едят одинаковую пищу. Это подчеркивает важность диеты в формировании этих микробных экосистем", — говорит ведущий автор Эрин Маккенни.
Кроме того, у венценосных и кошачьих лемуров с их диетой, богатой сахаром, обнаружились пять общих обогащенных метаболических путей с людьми, страдающими воспалительным заболеванием кишечника (IBD). У обоих в изобилии присутствовали микробные "механизмы", способные выполнять пять специфических функций.
"У людей считается, что эти метаболические пути могут способствовать проблемам со здоровьем кишечника. Но те же самые метаболические пути у лемуров, похоже, не вредят здоровью животных. Это поднимает интересные вопросы о роли этих метаболических путей у людей", — отмечает Маккенни.
Это открытие ставит вопрос: является ли связь этих микробов с IBD у людей причинно-следственной или лишь корреляционной.