Эволюция вируса гепатита B от древности до наших дней

Новое исследование в журнале Science, основанное на крупнейшем наборе древних вирусных геномов, раскрывает эволюцию вируса гепатита B (HBV) с начала голоцена.

HBV — серьёзная глобальная проблема здравоохранения, вызывающая около миллиона смертей в год. Исследование, проведённое международной командой, анализирует 137 древних геномов вируса из останков жителей Евразии и коренных американцев, датированных периодом от ~10 500 до ~400 лет назад.

HBV и заселение Америк

Современные штаммы HBV делятся на девять генотипов, два из которых встречаются преимущественно у популяций с происхождением от коренных американцев. Исследование доказывает, что эти штаммы происходят от линии HBV, которая отделилась в конце плейстоцена и была занесена первыми обитателями Америк.

«Наши данные предполагают, что все известные генотипы HBV происходят от штамма, который инфицировал предков первых американцев и их ближайших евразийских родственников в период расхождения этих популяций», — говорит Дениз Кюнерт, руководитель исследования.

HBV в доисторической Европе

Вирус присутствовал на большей части Европы уже 10 000 лет назад, до распространения земледелия.

«Многие человеческие патогены, как считается, появились после внедрения сельского хозяйства, но HBV явно уже поражал популяции охотников-собирателей», — отмечает Йоханнес Краузе, соавтор исследования.

После неолитического перехода в Европе штаммы HBV от охотников-собирателей были вытеснены новыми штаммами, вероятно, распространившимися с первыми земледельцами. Эти новые линии вируса доминировали в Западной Евразии почти 4000 лет, пережив даже масштабную экспансию скотоводов западных степей около 5000 лет назад, которая не привела к распространению новых вариантов HBV.

Упадок и повторное появление доисторического HBV

Одно из самых неожиданных открытий — резкое снижение разнообразия HBV в Западной Евразии во второй половине II тысячелетия до н.э., в эпоху крупных культурных сдвигов, включая крах развитых бронзовых обществ в восточном Средиземноморье.

«Это может указывать на важные изменения в эпидемиологической динамике в этот период, но для понимания произошедшего потребуются дополнительные исследования», — говорит Артур Кохер, ведущий автор работы.

Все древние штаммы HBV, обнаруженные в Западной Евразии после этого периода, принадлежали к новым линиям, которые преобладают в регионе и сегодня. Однако один вариант, связанный с прежним доисторическим разнообразием, сохранился до наших дней. Этот древний вариант эволюционировал в редкий генотип, который, по-видимому, возник недавно во время пандемии ВИЧ, по причинам, которые ещё предстоит понять.