Новое исследование происхождения вируса гепатита B

Исследователи представили новые данные о географическом происхождении и глобальном распространении двух генотипов вируса гепатита B (HBV), согласно исследованию в eLife.

Результаты указывают, что генотипы HBV-D и HBV-A возникли на Ближнем Востоке и в Северной Африке. Они также выявляют существенные различия в глобальных путях распространения этих генотипов, углубляя понимание как исторического, так и доисторического распространения одной из крупнейших вирусных пандемий в мире.

HBV, основная причина заболеваний печени, является глобальной проблемой общественного здравоохранения: по данным Всемирной организации здравоохранения (WHO), около 257 миллионов человек живут с этой инфекцией. Вирус классифицируется на девять генотипов (A–I). HBV-A и HBV-D распространены по всему миру: A преобладает в Европе и Африке, а D — в Европе и на Ближнем Востоке.

«Эпидемиологическая история HBV-D и HBV-A остаётся неясной из-за недостатка соответствующих исследований», — говорит ведущий автор Эвангелия-Георгия Костаки, докторант в области молекулярной эпидемиологии Национального и Каподистрийского университета Афин. Чтобы выяснить больше деталей, команда решила установить, как HBV распространялся по разным географическим регионам.

Для этого исследователи использовали 916 полногеномных последовательностей HBV-D и 493 последовательности HBV-A, чтобы реконструировать глобальное эволюционное развитие и диверсификацию (филогению) этих генотипов и проанализировать степень их региональной кластеризации.

Анализ показал, что географическое происхождение HBV-D находится в Северной Африке и на Ближнем Востоке, хотя точное место установить по имеющимся данным не удалось. Происхождение HBV-A, вероятно, близко к Африке и Европе, скорее всего, на Ближнем Востоке и в Центральной Азии.

«Основные пути распространения HBV-D были сложными и охватывали разные географические регионы, — объясняет старший автор Димитриос Параскевис, доцент эпидемиологии и превентивной медицины. — Мы обнаружили низкий уровень локальной передачи HBV-D в Северной Африке и на Ближнем Востоке, что указывает на высокую мобильность инфицированных HBV популяций в этих областях. Это согласуется с нашей предыдущей гипотезой о ключевой роли этих регионов как центров экспансии человека, связанной с ранним развитием земледелия и последующим распространением и генетическим перемешиванием HBV-D».

После первоначального распространения в Центральной Африке, генотип HBV-A пошёл по двум различным путям: один — в Восточную и Южную Африку, другой — в субсахарскую и Западную Африку. Позднее «утечки» привели к крупным региональным передачам в Бразилию, Гаити и на Индийский субконтинент, скорее всего, в результате работорговли.

Эти результаты подчёркивают существенные различия в глобальных паттернах распространения HBV-D и HBV-A, а также разный уровень их региональной кластеризации. Вероятно, это отражает влияние доисторических и более поздних миграций человека, а также других видов деятельности на эволюцию этих генотипов HBV.