Геномы красных и серых белок могут помочь сохранить красных белок в Британии и Ирландии

Ученые из Wellcome Sanger Institute и их коллабораторы завершили секвенирование референсных геномов красной и серой белки. Это открывает новые возможности для сохранения красных белок в Британии и Ирландии. Геномы могут содержать ключ к пониманию, почему серые белки невосприимчивы к беличьей оспе — заболеванию, смертельному для большинства красных белок.

Новые геномы — ценный ресурс, открывающий множество исследовательских путей, включая помощь в мониторинге генетического разнообразия популяций и изучении эволюционных признаков. Геномика поможет создать более четкую биологическую картину, предоставив высокоточные данные для разработки стратегий сохранения.

Красные белки (Sciurus vulgaris) являются аборигенным видом для Британии и Ирландии, но им угрожает исчезновение из-за потери среды обитания, конкуренции с серыми белками (Sciurus carolinensis) и смертельной беличьей оспы. В то время как серые белки невосприимчивы к болезни, вспышки оспы могут убивать до 80% популяции красных белок в пораженной области. Серые белки родом из Северной Америки и были завезены в Британию людьми в конце XIX века.

Из-за давления со стороны серых белок и вспышек оспы красные белки теперь обитают лишь в изолированных очагах в северной Англии и Уэльсе, а также в более связанной популяции в Шотландии и Ирландии. Небольшие фрагментированные популяции подвержены большему риску сокращения и могут страдать от генетического инбридинга.

Образцы красных и серых белок предоставили Lancashire, Manchester and Merseyside Wildlife Trust и аспирант Ноттингемского университета Трент Кэт Фингланд. Ученые из Wellcome Sanger Institute выделили ДНК и использовали технологии секвенирования PacBio SMRT и Illumina для создания первых высококачественных референсных геномов.

Ожидается, что геномы помогут понять генетическую основу иммунитета к беличьей оспе у серых белок, а также у небольшого процента красных белок, переживших вспышки. Геном также можно использовать для обеспечения генетического смешивания популяций, помогая отбирать животных для реинтродукции на основе их генетической совместимости с существующими популяциями, чтобы дать им наилучшие шансы на выживание через успешное размножение.

«Наши красные белки в серьезной беде, и геномы красных и серых белок станут ценным инструментом в нашей борьбе за их спасение. Нам нужно выяснить, находятся ли изолированные популяции, например, в Формби, Ланкашир, под угрозой инбридинга. Нам также нужны жизнеспособные решения угрозы беличьей оспы, и я надеюсь, что геном позволит исследователям это сделать», — сказала Рейчел Криппс, офицер по охране красных белок в Lancashire, Manchester and Merseyside Wildlife Trust.

«За последние два десятилетия генетическое управление сохранением красных белок основывалось на традиционных методах профилирования ДНК, которые не позволяют нам многое понять о генетических вариациях между видами или популяциями. Публикация геномов красных и серых белок позволит нам строить стратегии сохранения на гораздо большем объеме данных и отвечать на вопросы о том, чем популяции отличаются и какие последствия это может иметь для их успеха», — сказал доктор Роб Огден, руководитель отдела генетики сохранения в Эдинбургском университете.