Исследование: супербактерии в окружающей среде редко передаются людям. Больницы — более рискованная среда, чем фермы

Международная команда учёных, изучавшая передачу смертельно опасной устойчивой к лекарствам бактерии, сравнимой с MRSA, обнаружила, что, хотя эти патогены встречаются у домашнего скота, питомцев и в окружающей среде, они крайне редко передаются людям таким путём.

Исследователи под руководством профессора Эда Фейла из Центра эволюции Милнера Университета Бата изучили распространённость Klebsiella — семейства бактериальных видов, безвредно обитающих в кишечнике, но опасных при распространении на другие части тела.

Klebsiella pneumoniae — наиболее известный вид этого семейства, способный вызывать пневмонию, менингит, инфекции мочевыводящих путей и кровотока.

Эти бактерии теперь высокоустойчивы к антибиотикам, а некоторые штаммы устойчивы даже к карбапенемам — одному из классов антибиотиков «последней надежды», применяемых только когда другие методы лечения не работают.

В Великобритании Klebsiella обогнала MRSA как проблема здравоохранения, и её распространённость неуклонно растёт. ВОЗ признала эту бактерию критически важным внутрибольничным патогеном.

Помимо больниц, микроб ранее обнаруживали в окружающей среде, включая домашний скот и сточные воды, но до сих пор не было ясно, передаются ли бактерии между клинической и внеклинической средой.

В крупнейшем из когда-либо проводившихся исследований команда собрала 6 548 образцов за 15 месяцев в разных локациях в итальянском городе Павия и вокруг него, где этот патоген представляет серьёзную проблему в больницах. Образцы проанализировали с помощью методов полногеномного секвенирования для обнаружения и идентификации любых бактерий Klebsiella.

Команда взяла мазки у пациентов в больницах и здоровых «носителей» в сообществе, а также образцы с ферм, из луж, от домашних животных и даже комнатных мух и других насекомых.

Было обнаружено 3 482 изолята, включая 15 различных видов Klebsiella, причём половина положительных образцов содержала K. pneumoniae.

Генетическое секвенирование бактерий показало, что существует очень мало совпадений между штаммами, обнаруженными в больницах, и штаммами из окружающей среды.

Профессор Эд Фейл: «Мы обнаружили Klebsiella повсюду, но были удивлены, что штаммы в больницах отличались от штаммов в окружающей среде. Это указывает на очень слабый перенос между двумя средами обитания: люди почти всегда заражаются от других людей».

«Это подтверждает, что лучший способ контроля инфекции для этих бактерий остаётся строгая больничная гигиена, и что вероятность вспышек из-за контакта с животными или окружающей средой меньше, чем опасались ранее, по крайней мере, в такой стране с высоким уровнем ресурсов, как Италия».

Доктор Гарри Торп из Университета Осло (Норвегия), первый автор статьи: «Мы не нашли доказательств передачи от скота, почвы, загрязнённого салата или купания в заражённых озёрах. Однако мы обнаружили устойчивую Klebsiella у домашних питомцев, таких как кошки и собаки. Ветеринары и владельцы должны знать об этом, так как эти животные могут представлять риск распространения бактерий».

Работа опубликована в Nature Microbiology.

Профессор Фейл: «Мы изучили передачу штаммов, однако устойчивость к антибиотикам может легко передаваться другим штаммам при обмене кольцевыми молекулами ДНК — плазмидами. Далее мы хотим отследить, как плазмиды передаются между штаммами, используя метод длинного прочтения (long read sequencing)».