Суперкомпьютерные симуляции выявили потенциальные активные вещества против коронавируса

Несколько препаратов, одобренных для лечения вирусной инфекции гепатита C, были идентифицированы как потенциальные кандидаты против COVID-19 — болезни, вызываемой коронавирусом SARS-CoV-2. Это результат исследования, основанного на масштабных вычислениях на суперкомпьютере MOGON II в Университете имени Иоганна Гутенберга в Майнце (JGU).

Как сообщили исследователи в статье, опубликованной на сайте Всемирной организации здравоохранения (WHO), они смоделировали, как около 42 000 веществ из открытых баз данных связываются с определёнными белками SARS-CoV-2, тем самым ингибируя проникновение вируса в организм человека или его размножение.

Метод компьютерного моделирования, известный как молекулярный докинг, использовался для поиска активных веществ. С помощью суперкомпьютера MOGON II за два месяца было выполнено более 30 миллиардов отдельных расчётов.

Результаты симуляций

Было обнаружено, что соединения из четырёх препаратов против гепатита C — симепревира, паритапревира, гразопревира и велпатасвира — обладают высокой аффинностью, чтобы очень прочно связываться с SARS-CoV-2, и поэтому могут предотвращать заражение.

Дополнительным аргументом является то, что и SARS-CoV-2, и вирус гепатита C относятся к одному типу — это одноцепочечные РНК-вирусы.

Ещё одним сильным кандидатом против SARS-CoV-2 может быть природное вещество из японской жимолости (Lonicera japonica), уже используемое в Азии против других заболеваний.

Полученные результаты теперь необходимо проверить в лабораторных экспериментах и клинических исследованиях. Метод молекулярного докинга ранее уже успешно применялся в поиске активных веществ против коронавирусов MERS-CoV и SARS-CoV.