Шесть штаммов SARS-CoV-2

Вирус SARS-CoV-2, вызывающий пандемию COVID-19, представлен как минимум шестью штаммами. Несмотря на мутации, вирус демонстрирует низкую изменчивость, что является хорошей новостью для исследователей, работающих над вакциной.

Таковы результаты самого масштабного исследования секвенирования SARS-CoV-2, проведенного учеными Болонского университета на основе анализа 48 635 геномов коронавируса, выделенных в лабораториях по всему миру. Исследование опубликовано в журнале Frontiers in Microbiology и позволило отследить распространение и мутации вируса на всех континентах.

Ключевой вывод: коронавирус имеет низкую изменчивость — примерно семь мутаций на образец. Для сравнения, обычный грипп имеет более чем вдвое более высокий уровень изменчивости.

«Коронавирус SARS-CoV-2, по-видимому, уже оптимизирован для поражения людей, что объясняет его низкую эволюционную изменчивость, — объясняет координатор исследования Федерико Джорджи. — Это означает, что разрабатываемые методы лечения, включая вакцину, могут быть эффективны против всех штаммов вируса».

Шесть основных штаммов

  1. L — исходный штамм, появился в Ухане в декабре 2019 года.
  2. S — первая мутация, появилась в начале 2020 года.
  3. V и G — появились с середины января 2020 года.
  4. GR и GH — произошли от штамма G в конце февраля 2020 года.

Штамм G и его производные (GR и GH) являются наиболее распространенными, составляя 74% всех проанализированных геномных последовательностей. Они имеют четыре мутации, две из которых могут изменять последовательности белков РНК-полимеразы и Spike (шипа) вируса, что, вероятно, облегчает его распространение.

Географическое распространение

  • Европа и Италия: наиболее часты штаммы G и GR.
  • Северная Америка: наиболее распространен штамм GH.
  • Южная Америка: чаще встречается штамм GR.
  • Азия: увеличивается распространение штаммов G, GH и GR, которые попали туда только в начале марта (более чем на месяц позже, чем в Европу). Исходный штамм L постепенно исчезает.

Глобально штаммы G, GH и GR постоянно увеличивают свою долю. Штаммы S встречается в некоторых ограниченных районах США и Испании, а L и V постепенно исчезают.

Редкие мутации

Помимо шести основных штаммов, исследователи выявили некоторые редкие мутации, которые на данный момент не вызывают беспокойства, но должны находиться под наблюдением.

«Редкие геномные мутации составляют менее 1% от всех секвенированных геномов, — подтверждает Джорджи. — Однако их принципиально важно изучать и анализировать, чтобы определить их функцию и отслеживать распространение. Все страны должны вносить вклад в это дело, обеспечивая доступ к данным о последовательностях генома вируса».

Источник: Исследование «Geographic and Genomic Distribution of SARS-CoV-2 Mutations» опубликовано в журнале Frontiers in Microbiology.

2020-08-03