Вирусные "окаменелости" в геномах птиц встречаются реже, чем у млекопитающих

Исследование Университета Сиднея в рамках масштабного международного сотрудничества показало, что геномные "окаменелости" прошлых вирусных инфекций встречаются у птиц до 13 раз реже, чем у млекопитающих.

"Мы обнаружили, что только пять семейств вирусов оставили след в геноме птиц в ходе эволюции. Наше исследование предполагает, что птицы либо менее восприимчивы к вирусным вторжениям, либо эффективнее от них избавляются, чем млекопитающие", — сказал профессор Эдвард Холмс.

Результаты проливают свет на взаимодействие вируса и хозяина за 100 миллионов лет эволюции птиц.

Профессор Холмс — один из 200 ученых со всего мира, принявших участие в амбициозном проекте по секвенированию, сборке и сравнению полных геномов 48 видов птиц.

После четырех лет сотрудничества основные выводы опубликованы в журнале Science 12 декабря. Они включают новые данные о том, как птицы достигли впечатляющего биоразнообразия в более чем 10 000 видов.

"Одно из самых поразительных открытий — малый размер геномов птиц, и, кажется, малое количество вирусных окаменелостей соответствует этому", — отметил Холмс.

Вместе с постдокторантом Цзе Цуй профессор Холмс проанализировал 48 птичьих геномов на наличие "вирусных окаменелостей" — копий вирусов, встроившихся в геном и передающихся через поколения.

"Сравнительная геномика показала, что птицы несут значительно меньше таких вирусных или геномных окаменелостей, чем млекопитающие. Только пять семейств вирусов "посетили" птиц в ходе эволюции, наиболее распространены ретровирусы и гепаднавирусы (например, вирус гепатита B)", — сказал профессор Холмс.

"Следующий вопрос — способствует ли малый размер геномов птиц снижению числа этих вирусных окаменелостей?"

В международном проекте также участвовали девять ученых из Университета Сиднея, включая профессора Симона Хо. Результаты опубликованы в Science, Genome Biology, GigaScience и других журналах.