Структурные основы ингибирования NaV1.7 порамистыми блокаторами

Хроническая боль затрагивает около 20% населения. Натриевый канал NaV1.7 играет ключевую роль в передаче болевых сигналов в мозг, что делает его привлекательной мишенью для не вызывающих привыкания анальгетиков. Однако разработка селективных препаратов сложна из-за высокой гомологии последовательностей девяти изоформ каналов NaV.

Ученые из Института физики Китайской академии наук под руководством профессора Цзян Даохуа решили крио-ЭМ структуры NaV1.7 в комплексе с тремя химически различными низкомолекулярными ингибиторами: XEN907, TCN-1752 и NaV1.7-IN2.

Ключевые результаты:

  • Структура впервые показала N-концевой домен (NTD) NaV1.7, подтвердив его критическую роль для функции канала.
  • Центральная полость NaV1.7 содержит несколько сайтов связывания препаратов, которые напрямую блокируют канал.
  • Два ингибитора вызывали локальные конформационные перестройки S6-спирали:
    • XEN907 индуцировал переход α-спирали в π-спираль в S6IV, что значительно замедлило восстановление NaV1.7 от быстрой инактивации.
    • TC-N1752 вызвал сдвиг α-спирали в π-спираль в S6II и смещение S6II примерно на 5 Å к активационным воротам, полностью закрыв их и стабилизировав NaV1.7 в инактивированном состоянии.

Выводы и перспективы:

Сайты связывания ингибиторов в центральной полости высококонсервативны среди изоформ NaV, что объясняет сложность создания селективных препаратов, нацеленных на эту область. Исследование предполагает, что будущие поиски селективных ингибиторов NaV1.7 должны быть сосредоточены на менее консервативных областях, например, на домене, чувствительном к напряжению.

Исследование "Structural basis for NaV1.7 inhibition by pore blockers" опубликовано в Nature Structural & Molecular Biology.