Геном морской вши открывает новые возможности для борьбы с ней

Международная группа исследователей секвенировала почти весь генетический материал морской вши (Lepeophtheirus salmonis). 1 марта Институт морских исследований открыл всему миру доступ к этому ресурсу, что может позволить аквакультурной индустрии разработать новые и более эффективные лекарства против этого паразита.

Эта совместная работа знаменует собой первый случай секвенирования генома вида из класса веслоногих ракообразных (Copepoda) — одной из важнейших зоологических групп в морской пищевой цепи.

Тайны генома

Геном состоит из длинных цепочек, образованных четырьмя различными строительными блоками (нуклеотидами), которые содержат генетическую информацию организма. Закодированная в ДНК, эта информация контролирует развитие и характеристики организма. Секвенирование генома раскрывает точный порядок генетических блоков и может идентифицировать области, отвечающие за различные признаки.

«Мы заранее знали, что геном морской вши состоит примерно из 600 миллионов пар нуклеотидов. Теперь мы уверены, что секвенировали более 90% его генома», — говорит Расмус Скерн-Моритцен из Института морских исследований. Он руководит проектом Salmon Louse Genome Project, который является частью научной платформы PrevenT и ключевым компонентом скоординированных усилий Исследовательского совета Норвегии по борьбе с морской вошью.

Поиск уязвимостей

Перед секвенированием генома ученые сначала снизили его генетическую вариацию, скрещивая морских вшей в течение 27–30 поколений. Они применили три различные технологии, чтобы секвенировать как можно большую часть генома.

«Теперь у нас есть почти полный обзор генома морской вши, — с удовлетворением отмечает руководитель проекта. — Это дает нам инструмент для проведения гораздо более эффективных молекулярно-биологических исследований. В то же время это позволяет нам сравнивать морскую вошь с другими организмами и обнаруживать ее отличительные характеристики».

Международное сотрудничество

Вновь секвенированный геном считается ценным ресурсом не только для фундаментальных исследований, но и для фармацевтической промышленности, которая может использовать его при разработке лекарств для аквакультуры. В первые две недели после открытия доступа к геному морской вши с Расмусом Скерн-Моритценом связались более 20 исследователей.

«Пока запросы поступали исключительно от исследовательских институтов, но некоторые из них очень тесно сотрудничают с промышленностью».

Проект Salmon Louse Genome Project

• Проект является частью научной платформы Исследовательского совета PrevenT.
• В числе участников проекта: Институт морских исследований, Бергенский университет, Центр исследований морских вшей (Центр инноваций на основе исследований), Uni Research, Институт Макса Планка (Германия), Университет Виктории (Канада) и Европейский институт биоинформатики (Великобритания).
• Финансирование: проект получает финансирование от Центра исследований морских вшей, Института морских исследований, Норвежского фонда исследований морепродуктов (FHF) и Marine Harvest ASA.