Документирование мирового разнообразия сельскохозяйственных культур и обеспечение доступа к нему
Генбанки играют важную роль в долгосрочном сохранении генетических ресурсов растений для продовольствия и сельского хозяйства. Из 1800 коллекций генбанков по всему миру более 600 находятся в Европе. Этот огромный массив разнообразия культур может быть использован для повышения питательности, продуктивности и устойчивости наших сельскохозяйственных растений к вредителям, болезням и изменениям окружающей среды, но только при наличии информации о нём.
Европейский поисковый каталог генетических ресурсов растений (EURISCO) — это международная агрегированная база данных, которая служит центральной точкой входа для информации о большом генетическом разнообразии культур, сохранённом в более чем 400 институтах в 43 европейских и соседних странах.
Обновлённая информация о EURISCO недавно была опубликована в специальном выпуске журнала Nucleic Acids Research (NAR), посвящённом биологическим базам данных.
В настоящее время в EURISCO задокументировано более 2 миллионов образцов генетических ресурсов растений, включающих 6737 родов и 45 175 видов. Среди них — основные зерновые культуры, такие как пшеница и кукуруза, зернобобовые (фасоль, горох, вика), масличные культуры (подсолнечник, лён), клубнеплоды (картофель) и культуры рода Brassica.
Более 400 000 образцов являются частью Многосторонней системы доступа и распределения выгод (MLS) Международного договора о генетических ресурсах растений для производства продовольствия и ведения сельского хозяйства (ITPGRFA). Это означает, что соответствующие страны подтвердили их оперативную доступность на стандартных и согласованных на международном уровне условиях распределения выгод. Кроме того, в базе содержится 2,6 миллиона записей фенотипических данных, полученных в результате более чем 3800 экспериментов с материалами генбанков.
С момента первой публикации в выпуске NAR Database Issue в 2017 году объём данных в EURISCO непрерывно растёт:
- Количество организаций-поставщиков данных увеличилось с 376 до 402.
- Количество задокументированных образцов выросло более чем на 200 000.
- Количество точек фенотипических данных увеличилось на 2,2 миллиона (500%).
«Это показывает, что EURISCO неуклонно набирает признание в качестве репозитория для таких данных», — говорит координатор EURISCO Штефан Вайзе. — «Кроме того, данные о генетических ресурсах растений постоянно поддерживаются и пополняются поставщиками данных. Каждый год в EURISCO обновляется от 30 до 40 национальных наборов данных, в среднем по 350 000–400 000 образцов в год. В рамках Европейской кооперативной программы по генетическим ресурсам растений (ECPGR) мы организуем учебные семинары для поддержки поставщиков данных и, в конечном итоге, повышения качества данных».
В начале 2022 года пользовательский интерфейс EURISCO был полностью переработан. Теперь он включает:
- Комбинированный поиск по паспортным и фенотипическим данным.
- Фасетный поиск.
- Возможность выбора образцов на основе карты.
- Поисковые индексы для научных названий и общеупотребительных названий культур.
В 2023 году EURISCO также планирует расширение для включения данных о популяциях диких родичей культур in situ, которые являются ключевым ресурсом для программ по улучшению сельскохозяйственных растений.
«EURISCO является краеугольным камнем европейской информационной системы по генетическим ресурсам растений, и его дальнейшее развитие и укрепление являются ключевыми целями Стратегии по генетическим ресурсам растений для Европы», — заключил секретарь ECPGR Лоренцо Маджони.