Мимивирус в изоляции теряет часть генома
При отсутствии конкуренции с другими микроорганизмами мимивирус, крупнейший известный ДНК-содержащий вирус, теряет 17% своего генома. Это продемонстрировали исследователи из французско-американской коллаборации, включая учёных из CNRS, Университета Средиземноморья и Университета Прованса. Результаты опубликованы на этой неделе в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.
Гигант среди вирусов
Мимивирусы, открытые в 2003 году под руководством профессора Дидье Рауля, содержат около 900 собственных генов и являются крупнейшей известной группой ДНК-вирусов. Их обнаруживают в амёбах, которые могут обитать, например, в водяных контурах систем кондиционирования. Особенность мимивируса — его размер и уязвимость к заражению мелкими вирусами-вирофагами.
В естественной среде, внутри амёбы, мимивирусы живут в «сообществе» с другими вирусами и бактериями. Постоянный обмен генами между этими организмами и их хозяином-простейшим способствовал эволюции к «коммунальному» образу жизни.
В лаборатории исследователи культивировали мимивирус в одиночестве внутри амёбы, без контакта с другими организмами. В ходе ускоренной эволюции (всего 150 пассажей) они наблюдали сокращение размера его генома на 17%. Эта геномная потеря происходила в основном за счёт делеций (удалений) на обоих концах генома.
Результат изоляции
В отсутствие конкуренции с другими микроорганизмами внутри амёбы мимивирус устранил часть своего генома, в частности гены, участвующие в формировании длинных волокон, окружающих его капсид. Мимивирус стал «лысым». Исследователи также отметили, что он стал устойчивым к вирофагам.
Эта работа показывает, что смена экосистемы может быть связана с серьёзным и быстрым изменением генома микроорганизмов.