Новый метод отслеживания клеточной сигнализации

Исследователи из Онкологического центра Memorial Sloan-Kettering совместно с коллегами из Германии разработали новый метод для определения клеточного происхождения внутриклеточных и секретируемых белков в многоклеточных средах.

Метод, названный CTAP (cell type specific labeling using amino acid precursors), использует неспособность клеток позвоночных синтезировать незаменимые аминокислоты, необходимые для роста и гомеостаза. Исследование было опубликовано онлайн в журнале Nature Methods 30 июня 2013 года.

Эта технология предоставит учёным новый инструмент для всестороннего картирования межклеточной коммуникации, важной во всех аспектах развития, поддержания и реакции на терапию рака. Например, метод можно использовать для изучения сигнальных событий между нормальными и злокачественными клетками, чтобы лучше понять молекулярные механизмы, с помощью которых окружающие нормальные клетки влияют на рост опухоли и ответ на лечение.

Команда Готье и Миллера сконструировала клетки для экспрессии ферментов биосинтеза аминокислот, что позволило клеткам расти на собственном запасе аминокислот, произведённых из добавленных предшественников.

Исследователи также показали, что добавление тяжёлых стабильных изотопно-меченых форм этих предшественников приводит к включению тяжёлых аминокислот в белки, производимые в клетках, экспрессирующих фермент. Используя количественную масс-спектрометрию для поиска белков, содержащих эти стабильные изотопные метки, учёные смогли определить клеточное происхождение как внутриклеточных, так и секретируемых белков, идентифицированных в многоклеточной культуре.

Предоставляя возможность напрямую связывать белки с конкретными типами клеток, авторы считают, что этот новый метод будет полезен в исследованиях межклеточной коммуникации и открытия биомаркеров.