Новый метод секвенирования белков может изменить биологические исследования

Исследователи из Техасского университета в Остине представили новый, гораздо более чувствительный метод секвенирования белков. В отличие от существующих технологий, требующих миллионов молекул, он позволяет идентифицировать отдельные белковые молекулы. Этот прорыв может оказать серьёзное влияние на биомедицинские исследования, упростив поиск новых биомаркеров для диагностики рака и других болезней, а также углубив понимание работы здоровых клеток.

Результаты исследования опубликованы в журнале Nature Biotechnology.

"Мы создали, по сути, технологию, подобную ДНК-секвенированию, для изучения белков", — сказал профессор молекулярных бионаук и соавтор технологии Эдвард Маркотт.

Работа над проектом началась более шести лет назад с идеи адаптировать методы секвенирования нового поколения (NGS) для белков. NGS сделало полное секвенирование генома любого организма быстрым, точным и доступным.

Новая технология, названная флюоро-секвенированием одиночных молекул (single molecule fluorosequencing), позволяет одновременно секвенировать миллионы отдельных белковых молекул в одном образце. По мнению Маркотта, в будущем это число может достичь миллиардов.

Сравнение с текущим стандартом:

• Масс-спектрометрия (нынешний стандарт): обнаруживает белок только при наличии около миллиона его копий и имеет низкую пропускную способность (несколько тысяч типов белков на образец).
• Новый метод: обладает гораздо более высокой чувствительностью и пропускной способностью.

Это открывает возможности для более эффективного поиска биомаркеров болезней и принципиально новых исследований, например, изучения эволюции опухоли на уровне отдельных клеток, что может привести к разработке новых методов борьбы с раком.