Новый метод картирования белковых сигналов между здоровыми и больными клетками

Исследователи из Онкологического центра Слоуна-Кеттеринга в Нью-Йорке совместно с коллегами из Центра протеомики Тюбингена (PCT) разработали новый метод для определения клеточного происхождения внутриклеточных и секретируемых белков в многоклеточных средах.

Метод, названный CTAP (cell type specific labeling using amino acid precursors), использует неспособность клеток позвоночных синтезировать незаменимые аминокислоты. Команда под руководством докторов Николаса Готье и Мартина Миллера создала клетки, экспрессирующие ферменты биосинтеза аминокислот. Это позволило клеткам расти на собственном запасе аминокислот, произведённых из добавленных предшественников.

Использование стабильных изотопно-меченых форм этих предшественников привело к включению «тяжёлых» аминокислот в белки, производимые в клетках, экспрессирующих ферменты. Доктора Б. Суфи и Б. Мацек из PCT использовали количественную масс-спектрометрию для поиска белков, содержащих эти изотопные метки. Так можно определить клеточное происхождение белков в культуре смешанных клеток.

Значение метода:

• Даёт новый инструмент для всестороннего картирования межклеточной коммуникации.
• Критически важен для изучения развития рака, его поддержания и ответа на терапию.
• Позволяет изучать передачу сигналов между нормальными и злокачественными клетками, чтобы понять, как окружающие здоровые клетки влияют на рост опухоли и ответ на лечение.
• Полезен для исследований межклеточной коммуникации и открытия биомаркеров, так как напрямую связывает белки с конкретными типами клеток.