Новый метод изучения активности генов

Исследователи из Института молекулярной биологии Университета Квинсленда (IMB), Гарвардского университета и RocheNimblegen Inc. разработали новый метод анализа генетической информации, который раскрывает новые детали в понимании структуры и активности генов в организме.

Метод, опубликованный в престижном журнале Nature Biotechnology, позволяет исследователям глубже, чем когда-либо, проникать в человеческий геном.

Он сочетает существующие методы захвата генов с передовой технологией «глубокого секвенирования» (deep sequencing), которая позволяет параллельно считывать миллионы различных молекул ДНК.

Команда, включая доктора Тима Мерсера, доктора Марселя Дингера, Джо Кроуфорд и профессора Джона Мэттика из IMB, использовала новый метод для изучения человеческого транскриптома — набора РНК, экспрессируемых в разных клетках в конкретный момент времени.

«Каждая клетка тела имеет копию всего генома, но разные клетки используют разную генетическую информацию», — сказал доктор Мерсер, руководивший исследованием.

Анализ показал, что человеческий транскриптом ещё сложнее, чем считалось ранее. Метод выявил множество новых транскрибируемых версий важных генов, вызывающих рак и участвующих в развитии, а также множество новых РНК, не кодирующих белки. Это демонстрирует, что наше понимание экспрессии человеческих генов далеко от завершения.

«Этот метод, известный как RNA CaptureSeq, может сканировать весь геном с гораздо большим разрешением, чем было возможно ранее, для выявления областей, связанных со сложными заболеваниями, а также он менее затратен, чем традиционные генетические анализы», — отметил профессор Мэттик.

Метод открывает путь к дальнейшим исследованиям, которые смогут выявить различия в экспрессии генов, вызывающие вариации между клетками.