Быстрый анализ генома уиппета устанавливает новый стандарт для исследований биоразнообразия
Немецкие исследователи из отдела генетики человека Института медицинской диагностики Bioscientia и LOEWE-центра трансляционной геномики биоразнообразия (LOEWE-TBG) секвенировали и проанализировали полный геном собаки породы уиппет менее чем за неделю.
Это достижение может оказать долгосрочное влияние на геномные исследования в области сохранения видов и биоразнообразия. Исследование опубликовано в журнале GigaByte.
Новая технология и рекордное время
Анализ генома уиппета, одной из самых быстрых наземных животных, был проведён с использованием новой технологии точного секвенирования целых геномов длинными фрагментами (long reads). Проект имеет не только техническое, но и символическое значение для привлечения внимания к проблеме вымирания видов.
Значение для сохранения биоразнообразия
Быстрый анализ становится всё более важным для сохранения исчезающих видов.
- Профессор д-р Ханно Больц (Bioscientia): «Мы демонстрируем, что можем получить и проанализировать полную геномную информацию за несколько дней, а не месяцев».
- Д-р Карола Греве (LOEWE-TBG): «Такие проекты позволяют быстро получить важную генетическую информацию об исчезающих видах. Это помогает не только понять их эволюционные адаптации, но и разработать целенаправленные меры по сохранению».
Перспективы и дальнейшие проекты
- Отдел генетики человека Bioscientia, анализирующий тысячи геномов и экзомов ежегодно для диагностики редких заболеваний у людей, впервые применил инновационный метод «long read» секвенирования в генетической диагностике человека. Это позволит эффективнее выявлять генетические заболевания.
- Учёные LOEWE-TBG секвенируют геномы множества организмов — от бактерий до китов — для получения информации об эволюции, адаптациях и биологических взаимосвязях, что важно для фундаментальной науки и природоохранной деятельности.
- Помимо проекта с уиппетом, вскоре будет опубликовано совместное исследование об исчезающем виде — садовой соне, и уже ведутся несколько других совместных проектов по секвенированию.