Секвенирование популяции какапо: прорыв в генетике сохранения вида

Высококачественное секвенирование почти всей популяции какапо помогает Новой Зеландии управлять здоровьем этого вида, находящегося на грани исчезновения.

Это не только уже влияет на выживаемость какапо, но и разработанные методы работы с угрожаемыми популяциями, вероятно, станут основой для будущего науки о сохранении дикой природы в Новой Зеландии и во всем мире.

Современные методы, разработанные доктором Джозефом Гулином (Университет Отаго) и международной командой для изучения какапо, раскрыли важные аспекты биологии этих птиц. Методы, повторно используемый код и конвейер обработки данных являются моделью и инструментом для консервационной геномики других видов, особенно интенсивно управляемых. Результаты исследования опубликованы в Nature Ecology & Evolution.

Работа доктора Гулина привела к двум значимым результатам. Во-первых, она обеспечивает глубокое понимание биологии какапо, невозможное без геномики. Во-вторых, предоставляет высококачественный код и повторно используемый конвейер, позволяя другим исследователям быстро интегрировать эти методы в свою работу, что значительно продвинуло геномные возможности Новой Зеландии.

Это дало исследователям инструменты для выявления специфических генетических характеристик, критически важных для выживания.

«Используя технологию, созданную Google, мы достигли того, что, вероятно, является набором данных о генетических вариантах наивысшего качества для любого исчезающего вида в мире. Этот набор данных будет доступен, через DOC и Ngai Tahu, для будущих исследователей, работающих с какапо», — заявил доктор Гулин.

Научный советник Департамента охраны природы по программе восстановления какапо, доктор Эндрю Дигби, считает, что генетические инструменты этого исследования окажут огромное влияние на сохранение вида.

«Какапо страдают от болезней и низкой репродуктивной способности, поэтому, понимая генетические причины этих проблем, мы теперь можем помочь смягчить их. Это дает нам возможность прогнозировать такие вещи, как рост птенцов и восприимчивость к болезням, что меняет наши практики управления на местах и поможет повысить уровень выживаемости».

Хотя исследование знаменует начало новой эры генетики сохранения какапо, доктор Дигби отмечает его значение для будущего всех угрожаемых видов.

«Проект Kakapo125+ — отличный пример того, как генетические данные могут способствовать росту популяции. Разработанные новые генетические инструменты и инструменты машинного обучения могут быть применены для повышения продуктивности и выживаемости других охраняемых видов-таонга».