Расшифровка генома раскрывает тайны китайского аллигатора
Китайские учёные из Чжэцзянского университета и BGI завершили секвенирование и анализ генома находящегося под угрозой исчезновения китайского аллигатора (Alligator sinensis). Исследование, опубликованное в Cell Research, представляет первый опубликованный геном крокодилов и объясняет, как наземные рептилии адаптировались к водной среде и температурно-зависимому определению пола (TSD).
Китайский аллигатор — критически исчезающий вид: в дикой природе осталось ~100 особей, а в неволе содержится ~10 000 в провинциях Чжэцзян и Аньхой.
Учёные секвенировали геном особи из заповедника Чансин Иньцзябянь, получив черновую последовательность размером 2.3 Гб и предсказав 22 200 генов.
Анализ ДНК выявил генетические основы уникальных адаптаций:
- Долгое пребывание под водой: дупликация гена гемоглобина, связывающего бикарбонат, и позитивный отбор генов энергетического метаболизма.
- Мощные сенсорная и иммунная системы — признаки коэволюции при переходе обратно в воду.
- Отсутствие половых хромосом: геном первого секвенированного вида с TSD поможет понять эволюцию половых хромосом.
Как отметил Шэнкай Пань из BGI, эта работа важна для понимания адаптации вида и его сохранения.