Выпущены геномные метаболические базы данных ключевых зерновых культур

Исследователи из отдела биологии растений Института Карнеги опубликовали полные метаболические комплексы (геномного масштаба) для нескольких зерновых культур: риса, ячменя, сорго и проса. Вместе с кукурузой, чьи данные были опубликованы ранее, эти виды производят более 1.5 миллиарда тонн зерна ежегодно.

Цель проекта — понять, как эти растения используют солнечный свет для роста и производства семян. Это знание поможет:

  • Повысить урожайность сельхозкультур.
  • Бороться с мировым голодом.
  • Развивать производство биотоплива, что может снизить затраты на топливо и смягчить изменение климата.

Содержание баз данных: Они предоставляют детальное, геном-масштабное описание химических реакций, определяющих метаболическую жизнь растения. Это включает:

Все данные доступны для поиска, просмотра и загрузки на сайте проекта Plant Metabolic Network.

Дополнительные культуры: Помимо основных зерновых, выпущены метаболические комплексы:

  • Свитчграсса (Panicum virgatum) — перспективный источник биотоплива.
  • Брахиподиума (Brachypodium distachyon) — модельного организма для изучения всех злаков.

Также существенно расширены метаболические базы данных для 10 видов, уже представленных на сайте: кукурузы, сои, Arabidopsis, винограда, маниоки, тополя, мха, Selaginella, папайи и Chlamydomonas.

Значение: Вместе с общерастительной базой метаболических путей PlantCyc, сайт Plant Metabolic Network содержит крупнейшую в мире публично доступную коллекцию метаболической информации о растениях.

Цитата руководителя программы Сын Ён Ри: «Мы пытаемся понять, как организованы, функционируют и эволюционируют метаболические системы растений, чтобы в конечном итоге мы и другие могли конструировать различные растения... Эти знания необходимы для удовлетворения постоянно растущего спроса на производство пищи, биотоплива и фито-фармацевтических препаратов».