Новый ресурс раскрывает внутреннюю работу клеток сорго для создания лучшего сырья для биоэнергетики
Исследователи создали ценный новый ресурс для углубленного понимания сорго — важной культуры для производства биотоплива и биопродуктов.
Ключевые достижения:
- Метод: Адаптация техники лазерной микродиссекции (LCM) с УФ-лазером для изоляции типов клеток стебля сорго и последующее РНК-секвенирование.
- Результат: Построен атлас паттернов экспрессии генов на уровне отдельных типов клеток стебля на ранней вегетативной стадии роста. Стебли составляют 80% общей биомассы растения.
- Значение: Работа выявила специфичную для типов клеток экспрессию генов, пути метаболизма и регуляторные сети. Это позволяет разрабатывать промоторы, нацеленные на конкретные типы клеток, для точной генной инженерии.
Перспективы применения:
- Увеличение производства масла: Одна из проблем — масло не накапливается в самом abundant типе клеток (паренхиме сердцевины), а его высокое содержание на ранней стадии роста вредит растению. Промоторы, специфичные для типа клеток, могут перенаправить накопление масла в желаемые клетки и, в перспективе, на более подходящую стадию роста.
- База для исследований: Созданная база данных экспрессии генов служит инструментом для изучения молекулярных и физиологических признаков сорго на беспрецедентном уровне.
- «Растения как фабрики»: Исследование поддерживает подход CABBI по созданию устойчивых, высокопродуктивных трав, производящих большое количество липидов.
Исследование, опубликованное в The Plant Journal, проведено консорциумом Центра инноваций в области передовой биоэнергетики и биопродуктов (CABBI), Центра биоэнергетических исследований Великих озёр (GLBRC), Института биотехнологий ХадсонАльфа и Национальной лаборатории им. Пасифик Нортвест.
