Полная расшифровка геномов четырёх ключевых видов скота Внутренней Монголии

Внутреннемонгольский сельскохозяйственный университет (IMAU) и крупнейшая в мире геномная организация BGI совместно объявили о завершении полного секвенирования геномов четырёх важных видов-представителей Внутренней Монголии (Китай). Это монгольская овца, алтайский двугорбый верблюд, монгольская лошадь и монгольский крупный рогатый скот.

Эти геномные проекты имеют высокую ценность для генетического анализа важных хозяйственных признаков характерных монгольских видов, таких как быстрый рост и размножение, сильная устойчивость к болезням и высокое качество мяса. Полные геномы также закладывают важную геномную основу для дальнейшего развития животноводства.

Внутренняя Монголия, расположенная на севере Китая, — одна из важнейших баз сельского хозяйства и животноводства, где в 2011 году насчитывалось более 100 миллионов голов скота. Мировой рынок продукции монгольского животноводства составляет более 33 миллиардов долларов США годового дохода от широкого спектра продуктов, включая молочные продукты, изделия из кожи, шерсть, верблюжью шерсть и мясные продукты. Четыре основных вида — монгольская овца, алтайский двугорбый верблюд, монгольская лошадь и монгольский скот — являются наиболее продуктивными домашними животными в регионе. Они широко распространены по всей Внутренней Монголии и характеризуются устойчивостью к холоду и засухе, сопротивляемостью неблагоприятным экологическим условиям и скудной растительности.

В проекте использовалась стратегия секвенирования методом дробовика (whole genome shotgun, WGS) и технологии секвенирования следующего поколения. Были секвенированы библиотеки с различными размерами вставок: 170 п.н., 500 п.н., 800 п.н., 2 т.п.н., 5 т.п.н., 10 т.п.н. и 20 т.п.н. Размеры геномов четырёх видов составляют примерно:

• Монгольская овца: ~3 Гб
• Алтайский двугорбый верблюд: ~2.4 Гб
• Монгольская лошадь: ~2.8 Гб
• Монгольский скот: ~2.8 Гб

Профессор Хуаньминь Чжоу, руководитель проекта и директор по науке и технологиям IMAU, отметил, что полные последовательности геномов являются базовым генетическим ресурсом для дальнейшего изучения монгольских видов и обеспечивают критическую основу для лучшего понимания их генетических признаков и защиты важных генетических ресурсов Китая. Дальнейшая работа будет включать сравнительную геномику и эволюционный анализ.

Проект по геномам монгольских видов является частью инициативы BGI «1000 Plant and Animal Reference Genomes Project».