Геном крупного рогатого скота расшифрован в деталях

Международный консорциум ученых создал глобальную базу данных, которая на несколько порядков увеличила детализацию знаний о геномной вариативности крупного рогатого скота. Этот открытый ресурс станет важнейшим инструментом для исследований в области генетики скота и истории животноводства. Результаты опубликованы в престижном журнале Nature Genetics.

Ключевые быки-производители

Данные для масштабной базы получены от ключевых быков-производителей, оказавших огромное влияние на генетический состав и признаки современных пород. Например, голштинские быки из базы стали отцами как минимум 6.3 миллиона дочерей по всему миру.

В статье в Nature Genetics описаны данные по 232 быкам и двум коровам пород Ангус, Голштин, Джерси и Флекви. Эти животные несут большую часть генетических вариаций, присутствующих в породах. На данный момент база содержит геномы более 1200 животных разных пород, и она продолжает пополняться.

Высокий уровень детализации

Особенность базы — беспрецедентная детализация данных. Если раньше была известна лишь локализация генов и часть их вариантов, то теперь идентифицирована значительная часть общей вариативности, что позволяет предсказывать генотипы нового потомства. Эти данные можно связать с ключевыми признаками: здоровьем, отелом, фертильностью, удоем и ростом.

Раньше было картировано лишь около 2% вариаций. Теперь для множества ключевых предков известны все. Если проводить аналогию с картой, раньше мы видели только указатели километража на хромосомной дороге, а теперь видим всю дорожную карту.

Раньше мы работали примерно с 700 000 маркеров. С новой детальной базой у нас есть более 30 миллионов маркеров. Мы можем предсказывать генотипы всех животных на основе созданного ресурса.

Новая основа для генетической работы

Ученые заявляют, что база данных станет стандартным референсом в генетике крупного рогатого скота.

Это глобальный ресурс, который станет основой для всех генетических исследований крупного рогатого скота на многие годы вперед. Он открывает двери для дальнейшего изучения генетической вариативности разных признаков и для получения новой информации об истории скота.

Имея такие детальные данные, мы можем более легко и эффективно фокусировать селекционную работу на улучшение здоровья, благополучия и продуктивности скота. Мы уже использовали данные проекта для идентификации вариаций в генах, ассоциированных как с гибелью эмбрионов (основная причина снижения фертильности), так и с удоем.