Расшифрован геном шашечницы Галатеи

Шашечница Галатея (Melitaea cinxia) давно является международно признанным модельным видом в экологии и эволюционной биологии. Теперь её значимость возросла: группа под руководством профессора Илкки Хански из Университета Хельсинки секвенировала полный геном этой бабочки.

Ключевые достижения исследования:

  • Первый в Финляндии: До этого генома длиной ~390 млн пар оснований в стране секвенировали только геномы вирусов и бактерий.
  • Третья бабочка: Шашечница Галатея стала третьим видом бабочек (после шелкопряда и геликонии) с полностью расшифрованным геномом и высокоточной генетической картой.
  • Карта генов: Карта показывает расположение около 16 000 генов на 31 хромосоме вида.

Научные открытия:

  • Подтверждена гипотеза профессора Эско Суомалайнена (1960-е гг.) о том, что предковый вид чешуекрылых имел 31 хромосому.
  • Обнаружена необычайная стабильность генома. Как поясняет участник исследования Микко Фриландер: «Гены оставались в тех же хромосомах практически на протяжении всей эволюционной истории бабочек — по крайней мере, 140 миллионов лет. Такая стабильность почти уникальна среди всех организмов. Что ещё более удивительно, даже после слияния хромосом в ходе эволюции гены остаются на своей исходной стороне».

Цель и перспективы:

Исследовательская группа ставит целью объединить генетические и геномные исследования с экологическими и эволюционно-биологическими. «Мы хотим, чтобы шашечница Галатея стала новой модельной системой для интегративной биологии. Следующая задача — заинтересовать этим видом больше биологов», — заявляет профессор Илкка Хански.

Проект и участники:

Четырёхлетний проект финансировался Европейским исследовательским советом и Академией Финляндии. Основные этапы:

  • Секвенирование: Проведено в Институте биотехнологии Университета Хельсинки под руководством Петри Аувинена.
  • Сборка генома: Осуществлена Пану Сомервуо и Линой Салмелой.
  • Аннотация генов: Выполнена Вирпи Ахола совместно с профессором Лисой Хольм и Патриком Коскиненом.
  • Генетическая карта: Построена с помощью инструмента, разработанного Паси Растасом.