За пределами подсчёта видов: использование эволюционной истории для сохранения биоразнообразия

Темпы исчезновения видов на Земле вызывают тревогу. Ограниченные ресурсы заставляют специалистов по охране природы выбирать приоритетные регионы, часто ориентируясь на видовое богатство и эндемизм (высокую долю видов, не встречающихся больше нигде).

Однако у этого подхода есть серьёзный недостаток: он игнорирует эволюционную историю. "Не учитывая разнообразие, возникшее в ходе эволюции, современные оценки биоразнообразия могут упускать уникальные и важные для сохранения регионы", — поясняет доктор Роксанн Келлар, ведущий автор исследования, опубликованного в Applications in Plant Sciences.

Несмотря на аргументы в пользу включения эволюционной истории в стратегии охраны, метрики филогенетического разнообразия не получили широкого распространения. Цель исследования — эмпирически проверить доступные инструменты, чтобы помочь экологам выбрать подходящие метрики.

Учёные протестировали дюжину распространённых метрик на примере двух крупных семейств цветковых растений прерий: сложноцветных (подсолнечник) и бобовых (горох). Результаты подчеркивают различия между метриками и сложности сбора данных для их точного расчёта.

Основная проблема — получение филогении (эволюционного древа) для изучаемого региона. Необходимо отобрать большую долю присутствующих видов и получить для них одинаковый набор генов.

"Существует заблуждение о доступности данных в онлайн-репозиториях, например, в GenBank", — отмечает Келлар. Хотя это огромный ресурс, его часто недостаточно для точных расчётов, и учёным приходится генерировать данные самостоятельно.

После получения филогении рассчитать метрики относительно просто. Авторы оптимистичны: по мере роста объёмов данных от высокопроизводительного секвенирования и публикации большего числа филогений расчёт надёжных метрик биоразнообразия станет рутинной практикой.