Исследование экскрементов африканских животных проливает свет на формирование кишечной экосистемы
Исследование слонов, жирафов и других диких животных в национальном парке Этоша в Намибии подчеркивает, как окружающая среда, биологический пол и анатомические различия могут влиять на вариативность кишечного микробиома у травоядных видов. Поскольку микробиом кишечника играет критическую роль в здоровье животных, эта работа может быть использована для информирования природоохранных усилий.
Для исследования ученые разделили Этошу на три зоны в зависимости от количества осадков. Разнообразие и обилие видов растений варьировалось от зоны к зоне, но девять из 11 видов травоядных встречались во всех трех зонах. Были собраны свежие образцы фекалий 11 видов, включая африканских слонов (Loxodonta africana), ангольских жирафов (Giraffa camelopardalis angolensis), гну, два вида зебр и несколько видов антилоп.
Исследователи использовали экстракцию ДНК и секвенирование для идентификации бактерий в фекалиях, что дало информацию о типах и обилии бактерий в кишечном микробиоме каждого животного. Было получено 312 образцов фекалий.
Ключевые выводы:
Пять типов бактерий служат индикаторами окружающей среды. Их относительное количество предсказуемо менялось от зоны к зоне. Все эти микробы известны способностью расщеплять липиды или клетчатку на усваиваемые питательные вещества. Один из этих индикаторов — целый тип бактерий, ранее обнаруженный в микробиоме верблюдов, что указывает на его роль как надежного индикатора условий в засушливых местах.
Обнаружены микробные различия, связанные с биологическим полом и морфологией кишечника у разных видов.
У слонов были обнаружены два типа «основных» микробов, редко встречающихся у других видов. Это, вероятно, связано с тем, что слоны потребляют более широкий спектр растительных материалов. Из 22 типов основных бактерий, обнаруженных в целом, 20 были общими для нескольких видов — только два типа, найденные у слонов, не были распространены у других.
Работа важна, так как предоставляет высокодетализированные данные из ранее неисследованного региона. Она устанавливает базовый уровень для мониторинга изменений, что особенно актуально в свете опустошительных пожаров в парке Этоша, которые могут изменить рацион животных.