Образ жизни важнее географии для микробиома кишечника
Исследование Университета Вашингтона в Сент-Луисе показало, что бактериальные сообщества в кишечнике человекообразных обезьян в зоопарках США больше похожи на микробиом людей, придерживающихся не-западной диеты, чем на микробиом их диких сородичей. Более того, даже у диких обезьян, никогда не сталкивавшихся с антибиотиками, обнаружены микробы с генами устойчивости к ним.
Результаты, опубликованные в The ISME Journal, говорят о том, что контакт с людьми формирует микробиом кишечника горилл и шимпанзе. Изучение микробиома диких обезьян может дать ключ к пониманию взаимодействия человека и приматов, что важно для защиты исчезающих видов. Работа также предлагает способ выявлять новые гены антибиотикорезистентности до их широкого распространения среди бактерий человека, давая время на разработку контрмер.
Сравнение микробиомов
- Исследователи проанализировали образцы фекалий 18 диких и 18 зоопарковых шимпанзе, 28 диких и 15 зоопарковых горилл, а также 81 человека, живущего на окраине национального парка Нуабале-Ндоки в Республике Конго.
- Данные сравнили с общедоступной информацией о микробиомах людей из США, Перу, Сальвадора, Малави, Танзании и Венесуэлы с разным образом жизни (охотники-собиратели, сельские жители, горожане).
- Микробиомы людей разделились на две группы: 1) не-западная диета (много овощей, мало мяса и жира), 2) западная диета (много мяса). Дикие обезьяны образовали третью, отдельную группу. Микробиомы обезьян в зоопарках попали в первую группу, оказавшись ближе к людям с не-западным питанием.
Гены устойчивости и сохранение видов
- В образцах диких обезьян и местных жителей Конго обнаружены ранее неизвестные гены устойчивости к антибиотикам, в том числе к колистину — антибиотику «последней линии обороны». Пока эти гены находятся у безвредных для человека бактерий, но способность бактерий обмениваться генами представляет потенциальный риск.
- Учёные предлагают использовать мониторинг микробиома как инструмент для оценки воздействия антропогенных угроз (уничтожение среды обитания, браконьерство, болезни) на исчезающих шимпанзе и находящихся в критической опасности западных равнинных горилл.
Перспективы исследований
- Тэйт Кэмпбелл, первый автор: «Изучение этих новых генов в окружающей среде позволяет нам исследовать их и, возможно, найти способы подавить их до того, как они появятся у человеческих патогенов».
- Дэвид Морган, соавтор: «Было бы интересно расширить это исследование на другие контексты, например, зоны коммерческих вырубок и туризма. Прибытие людей и связанные с этим нарушения могут подвергнуть диких обезьян воздействию генов устойчивости».