Генетическое сокровище древнего бизона для фермеров
Генетическая информация из вымершего вида бизона, сохранившаяся в вечной мерзлоте тысячи лет, может помочь улучшить современное сельскохозяйственное животноводство и программы разведения. К такому выводу пришли исследователи из Университета Аделаиды.
Учёные из Австралийского центра древней ДНК (ACAD) университета совместно с международной командой проанализировали генетические мутации древнего бизона, многих современных пород крупного рогатого скота и других представителей семейства жвачных, включая оленей, антилоп и жирафов.
Их результаты, опубликованные в Proceedings of the National Academy of Sciences, открывают путь для выявления важных мутаций у предков домашних животных, заявляет директор ACAD профессор Алан Купер.
«Весь древний геном бизона был просканирован с помощью бычьего SNP-чипа, который одновременно картирует изменения в 54 000 специфических участках генома. Это первый случай, когда такая техника была использована для изучения генетической вариации любого вымершего вида», — говорит профессор Купер.
Бычий SNP-чип использовали для сканирования геномов 61 вида жвачных и 48 пород крупного рогатого скота, чтобы создать детальную эволюционную историю этой сложной группы, что было трудно сделать с помощью традиционных генетических исследований.
«Мы были удивлены, обнаружив, что можем генерировать данные очень высокого качества для видов, для которых чип не был предназначен», — говорит руководитель исследования профессор Джерри Тейлор из Университета Миссури.
Проанализировав огромное количество мутаций в разных геномах, исследователи смогли получить гораздо более полную картину семейного древа жвачных, а также раскрыть взаимосвязи и перемещения современных пород скота во времени.
«Понимание того, как разные гены создают вариации, контролирующие эффективность роста, уровень мраморности (внутримышечного жира) и устойчивость к болезням, может оказать большое экономическое влияние на фермеров по всему миру», — говорит профессор Тейлор.
Постдокторант ACAD доктор Кефей Чен в рамках программы, финансируемой Австралийским исследовательским советом, уже использовал этот подход для анализа геномов вымершего тура (предка современного скота), а также ранних домашних коров из Китая, России и Европы.
«Мы используем этот подход, чтобы отследить генетические изменения, произошедшие во время одомашнивания, когда большая часть разнообразия видов-предков была утрачена из-за очень сильного отбора, применявшегося ранними фермерами по нескольким генетическим признакам, таким как послушность, быстрый рост и уровень рождаемости», — говорит профессор Купер.
«Утраченное генетическое разнообразие может содержать всевозможную ценную информацию для современного сельского хозяйства, включая важные адаптации к изменению климата».