ДНК-зонд

Одноцепочечный фрагмент ДНК, помеченный радиоактивной меткой или ферментом, который был получен методом клонирования. ДНК-зонды применяются в реакции гибридизации для решения двух основных задач:

• Локализация специфических последовательностей нуклеиновых кислот (НК) непосредственно в хромосомах.
• Экспресс-идентификация микроорганизмов в исследуемом материале (например, в клинических образцах).

Современный контекст

Концепция ДНК-зондов остаётся фундаментальной для молекулярной биологии и диагностики, однако технология их применения значительно эволюционировала.

• Метки: Радиоактивные метки (например, на основе изотопа фосфора-32) сегодня используются реже из-за требований безопасности и сложности утилизации. Им на смену пришли безопасные флуоресцентные и хемилюминесцентные метки, а также ферментные системы (например, на основе пероксидазы хрена), выявляемые с помощью субстратов.
• Синтез: Современные зонды часто синтезируют искусственно (олигонуклеотидные зонды), а не выделяют из клонированных фрагментов, что позволяет быстро создавать зонды к любому известному участку генома.
• Применение: Методы на основе ДНК-зондов лежат в основе таких широко используемых технологий, как флуоресцентная in situ гибридизация (FISH) для цитогенетики, ДНК-микрочипы, а также многие протоколы ПЦР (полимеразной цепной реакции) в реальном времени, где зонд служит для детекции накопления специфического продукта.