SARS-CoV-2 перешел от летучих мышей к людям без значительных изменений

Исследование, опубликованное в журнале PLOS Biology, показывает, что в первые 11 месяцев пандемии (с декабря 2019 года) в сотнях тысяч секвенированных геномов SARS-CoV-2 наблюдалось очень мало «важных» генетических изменений.

Ключевые выводы:

• Низкая скорость адаптации: SARS-CoV-2 изначально обладал высокой способностью к передаче между людьми, не требуя длительного периода адаптации в новом виде-хозяине.
• Доминирование нейтральной эволюции: Большинство накопленных мутаций были эволюционно нейтральными и «путешествовали» вместе с вирусом благодаря миллионам актов передачи в высоковосприимчивой популяции.
• Доисторическая адаптация: Значительные изменения, наделившие вирус свойствами «генералиста» (способностью инфицировать людей и других млекопитающих), произошли у предков SARS-CoV-2 в популяциях летучих мышей до перехода к человеку. Этому свидетельствует, например, структура генома близкородственного вируса летучих мышей RmYN02.
• Смена эволюционных «передач»: Ускорение эволюции и появление более мутировавших линий к концу 2020 года связано с изменением иммунологического профиля человеческой популяции. Вирус стал сталкиваться с растущим иммунитетом, что создало давление отбора в пользу вариантов, способных его обходить.

Важный вывод для настоящего момента:

SARS-CoV-2 остается острым вирусом, который иммунная система побеждает в большинстве случаев. Однако он всё быстрее удаляется от варианта января 2020 года, на основе которого созданы текущие вакцины.

«Первая гонка была за разработкой вакцины. Теперь гонка — вакцинировать глобальное население как можно быстрее», — отмечает профессор Дэвид Робертсон.

Существующие вакцины по-прежнему эффективны против большинства циркулирующих вариантов, но чем больше времени проходит и чем больше разрыв между числом вакцинированных и невакцинированных, тем выше вероятность появления вариантов, ускользающих от вакцинного иммунитета.