Метод SPLASH открывает путь к таргетированию РНК для борьбы с устойчивостью микробов

Исследователи из Сингапура разработали новый высокопроизводительный метод SPLASH (Sequencing of Psoralen Linked And Selected Hybrids), который позволяет в беспристрастном и крупномасштабном режиме идентифицировать, как молекулы рибонуклеиновой кислоты (РНК) взаимодействуют внутри клеток.

Метод был использован для описания РНК-сети в клетках человека и дрожжей, её динамики, а также того, как структурная организация влияет на процессы трансляции и распада РНК в клетке.

Разработка велась под совместным руководством докторов Ван Юэ и Ниранджана Нагараджана из Института генома Сингапура (GIS) A*STAR и была опубликована 12 мая 2016 года в журнале Molecular Cell.

Значение метода

• РНК играют ключевую роль в регуляции экспрессии генов. В то время как взаимодействия белков и хроматина изучены хорошо, о том, как РНК взаимодействуют друг с другом, известно меньше. SPLASH призван восполнить этот пробел.
• Доктор Ван Юэ отметила, что РНК-сети динамичны и важны для функции клетки, а их таргетирование может стать способом подавления инфекционных организмов.

Перспективы применения

• Метод позволит изучать транскриптомы патогенных бактерий, вирусов денге и Зика, чтобы понять, как структуры и сети РНК в этих геномах способствуют заражению клеток человека.
• Это исследование патогенности микробов может внести вклад в создание новых антимикробных препаратов, противовирусных средств или вакцин.
• Доктор Нагараджан добавил, что теперь есть инструменты, чтобы понять, как организация РНК влияет на болезни и биологию патогенов, с конечной целью создания новых лекарств.