Консорциум по секвенированию пшеницы выпустил ключевой ресурс для научного сообщества
Международный консорциум по секвенированию генома пшеницы (IWGSC), завершив контроль качества, предоставляет научному сообществу полногеномную сборку хлебной пшеницы. Ресурс доступен через репозиторий последовательностей IWGSC в URGI-INRA (Версаль, Франция).
Этот прорывной ресурс позволит селекционерам и ученым ускорить программы по улучшению сельскохозяйственных культур и геномные исследования. Набор данных облегчит идентификацию генов, связанных с важными признаками, такими как урожайность, устойчивость к стрессам и болезням, что в конечном итоге приведет к созданию улучшенных сортов пшеницы.
Качество и характеристики сборки:
- Сборка основана на данных секвенирования Illumina, собранных с помощью программного обеспечения NRGene DeNovoMAGIC™.
- Она точно представляет более 90% высококомплексного генома пшеницы.
- Содержит свыше 97% известных генов.
- Данные привязаны к 21 хромосоме пшеницы.
Данный релиз — часть усилий IWGSC по созданию «эталонной последовательности золотого стандарта» — полной карты всего генома. Геном пшеницы в 5 раз больше человеческого и сложен, так как содержит три набора из семи хромосом.
Политика доступа и публикации:
Данные публикуются в соответствии с «Торонтским заявлением» о предпубликационном обмене данными. IWGSC оставляет за собой право первой публикации анализа данных, включая описание целых хромосом или общегеномный анализ генов, семейств генов, повторяющихся элементов и сравнений с другими организмами.
Дальнейшие планы:
Консорциум продолжит работу над созданием высококачественной упорядоченной последовательности генома пшеницы, включая аннотацию и точное определение местоположения генов. Ожидается, что эталонная последовательность «золотого стандарта» будет выпущена в 2017 году.
Контекст и значение:
Пшеница — основной продукт питания для более трети мирового населения и источник 20% всех потребляемых калорий. Чтобы удовлетворить спрос растущего населения, урожайность пшеницы должна увеличиваться на 1,6% ежегодно. Подробно аннотированная эталонная геномная последовательность станет бесценным ресурсом для достижения этой цели.